[发明专利]一种用于动物个体身份识别和/或肉产品溯源的条形码编制方法及其应用

说明书

技术领域

本发明属于分子生物学领域，涉及一种用于动物个体身份识别和/或肉产品溯源的条形码编制方法及其应用。

背景技术

猪肉是我国居民消费的最主要肉类产品，我国也是生产和消费猪肉量最大的国家。食品安全近年频发，已成为舆论焦点。建立可靠的猪肉产品溯源系统，实现猪场到餐桌全程双向可追溯，对兽药残留、瘦肉精、重金属滥用等问题猪肉生产的遏制，传染性疾病，特别是人畜共患病传染性疾病的切断及处理，市场消费信心的培育，养猪业的健康发展等，起至关重要的作用。

猪肉产品溯源的技术方法很多，由于技术简单、低成本及实际操作简易，目前大都采用耳标等标签溯源技术，但缺点是标签易丢失、受损、易混淆，易在猪活体、胴体和猪肉产品间分离，且缺乏可信度。DNA溯源技术基于基因组DNA的遗传与变异，目前用于肉产品溯源技术主要是AFLP、SSR及SNP三种。其中，SNP（single-nucleotide polymorphism，单核苷酸多态性）标记是第三代溯源技术。SNP是指同一物种不同成员间或同一个体的成对染色体在同一基因组DNA位点上出现的单个核苷酸之间的变异。例如，如果来自不同个体的同一基因组位点DNA片段序列分别为AAGCCTA和AAGCTTA,则此段DNA片段序列就存在一个SNP位点，等位基因为C和T。几乎所有常见的SNP均只有两个等位基因，但就个体而言，其成对染色体可能为不同的等位基因。因此，群体中一个常见的SNP位点通常存在三种基因型。以上述SNP为例，其群体中存在的基因型一般为C/C（个体的两条染色体上的等位基因均为C）、T/T（个体的两条染色体上的等位基因均为T）和T/C（个体的两条染色体上的等位基因分别为C和T）。相对而言，基因编码区比非编码区在进化上存在更大的压力，因此SNP通常出现在非编码区。由于种群的地理隔绝，可导致SNP在不同种群中的频率不同，一个在某个地理种群或种族中常见的SNP等位基因可能极少出现在另一个种群或种族内。再者，SNP是可遗传的变异中最常见的一种，具有分布广、密度高的特点，基因组DNA中平均约每1000bp，甚至高突变区段每200-300bp就存在1个SNP位点，因此，SNP常被开发为DNA指纹，用于动物的个体身份认证，因此研发猪个体身份识别或猪肉产品溯源的SNP条形码及相应的数字条形码意义重大。

发明内容

本发明的目的提供一种用于动物个体身份识别和/或肉产品溯源的条形码编制方法。

本发明的另一目的在于提供利用该方法编制的条形码。

本发明的又一目的是提供该条形码编制方法的应用。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

一种用于动物个体身份识别和/或肉产品溯源的条形码编制方法，选择待识别动物或待溯源肉产品的基因组DNA上的高杂合度的SNP位点并组合成SNP条形码，然后用十种阿拉伯数字0～9随机唯一的替代SNP条形码中的10种SNP基因型：A/A、T/T、G/G、C/C、A/T、A/G、A/C、T/G、T/C、G/C，形成相应的数字条形码，实现动物个体身份与SNP条形码以及数字条形码的一一对应。

所述的高杂合度SNP位点优选杂合度大于等于0.1的SNP位点。

所述的高杂合度SNP位点是根据GenBank登录的待识别动物或待溯源肉产品的基因组DNA序列设计引物，以待识别动物或待溯源肉产品基因组DNA为模板，进行PCR扩增，扩增产物测序，并筛选杂合度大于等于0.1的SNP位点。

所述的动物优选猪，所述的肉产品优选猪肉。

所述的猪或猪肉产品的基因组DNA上的高杂合度的SNP位点优选根据GenBank登录的猪基因组DNA序列设计引物对1～7，以猪基因组DNA为模板，进行PCR扩增，扩增产物测序，并筛选杂合度大于等于0.1的SNP位点；其中所述的引物对1的正向引物为SEQ ID No.1，反向引物为SEQ ID No.2；所述的引物对2的正向引物为SEQ ID No.3，反向引物为SEQ ID No.4；所述的引物对3的正向引物为SEQ ID No.5，反向引物为SEQ ID No.6；所述的引物对4的正向引物为SEQ ID No.7，反向引物为SEQ ID No.8；所述的引物对5的正向引物为SEQID No.9，反向引物为SEQID No.10；所述的引物对6的正向引物为SEQ ID No.11，反向引物为SEQ ID No.12；所述的引物对7的正向引物为SEQ ID No.13，反向引物为SEQ ID No.14。