[发明专利]青虾KSPI基因、其扩增方法及扩增引物组无效
申请号: | 201110303774.8 | 申请日: | 2011-10-10 |
公开(公告)号: | CN102367440A | 公开(公告)日: | 2012-03-07 |
发明(设计)人: | 傅洪拓;张响;乔慧;蒋速飞 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 李纪昌 |
地址: | 214081*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 青虾 kspi 基因 扩增 方法 引物 | ||
技术领域
本发明涉及基因克隆领域,特别涉及青虾KSPI基因、其扩增方法及扩增引物组。
背景技术
丝氨酸蛋白酶抑制因子(Serine proteinase inhibitor,SPI)是一类广泛存在于各种生物体内的蛋白,在变态、伤口愈合、先天免疫等过程中具有重要的作用。丝氨酸蛋白酶抑制因子主要包括serpin、α-巨球蛋白、Kazal型、Kunitz型等抑制因子家族,其中Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制因子(Kazal-type serine proteinase inhibitor,KSPI)是研究最广泛的酶抑制因子家族之一。KSPI最早发现于哺乳动物,随后又在克氏原鳌虾(Procambarus clarkii)、南美白对虾(Litopenaeus vannamei)、斑节对虾(Penaeus monodon)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)、弓形虫(Toxoplasma gondii)和家蚕(Bombyx mori)等多种动物中被鉴定。KSPI在抗凝血、调控自我吞噬和机体防御等过程中具有重要的作用。最近研究发现,KSPI在生殖方面有着重要的功能。Li等在罗氏沼虾的研究中发现,KSPI能够抑制生殖腺中精子明胶酶的活性,推测KSPI可能在罗氏沼虾生殖过程中发挥某种重要作用。Jalkanen等在小鼠的研究中发现,KSPI对小鼠精子的成熟起调节作用。
青虾(Macrobrachium nipponense)是我国重要的淡水养殖经济品种。目前青虾的分子研究多集中在群体遗传多样性方面,其基因克隆研究较少,而对青虾KSPI基因克隆的研究尚未见报道。本研究拟以青虾为实验材料,根据本实验室青虾精巢cDNA文库中筛选到的一个KSPI基因片段,通过RACE技术克隆出该基因全长cDNA序列,以期为后续青虾KSPI基因功能的研究奠定基础, 同时为甲壳类生殖研究积累背景资料。
发明内容
有鉴于此,本发明提供青虾KSPI基因、其扩增方法及扩增引物组。利用本发明提供的引物组从青虾精巢组织中克隆到了KSPI基因序列,对青虾KSPI基因功能的研究奠定基础,同时为甲壳类生殖研究积累背景资料。
为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:
本发明提供了青虾KSPI基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
本发明还提供了用于扩增青虾KSPI基因的引物组,其由如下引物组成:
引物组:
正向外引物3 KSPI 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
正向内引物3 KSPI 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
反向外引物5 KSPI 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
反向内引物5 KSPI 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
本发明还提供了一种扩增青虾KSPI基因的方法,包括如下步骤:
步骤1:获得青虾脑组织总RNA;
步骤2:合成cDNA;
步骤3:从本实验室构建的青虾精巢cDNA文库中筛选到KSPI基因片段,以此作为中间序列;
步骤4:用引物组扩增获得青虾KSPI基因片段的3’端和5’端片段;所述引物组由如下引物组成:
正向外引物3 KSPI 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
正向内引物3 KSPI 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
反向外引物5 KSPI 1的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
反向内引物5 KSPI 2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
步骤5:将所述KSPI基因cDNA序列的中间片段、所述KSPI基因的3’端和5’端片段拼接,即得。
作为优选,步骤4所述扩增为套式两轮PCR。
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