[发明专利]一种预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法

权利要求书

1.一种预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：其包括以下步骤：

(1)获取抗生素理化参数；

(2)获取受体蛋白及构建其同源模型，测定抗生素与受体蛋白的相互结合能；

(3)测定抗生素联合毒性；

(4)以抗生素理化参数、抗生素与受体蛋白的相互结合能和抗生素联合毒性为基础，建立慢性联合毒性预测模型；

(5)应用步骤(4)得到的模型预测抗生素联合毒性。

2.如权利要求1所述的预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：所述抗生素的理化参数，包括最高占有轨道能、解离常数pKa、极化率、偶极矩、分子体积、吉布斯自由能和分子最高-低轨道占有能差E_h-l。

3.如权利要求1所述的预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：所述获取抗生素的理化参数，具体包括以下步骤：

1、采用程序Chemoffice获取小分子结构及其分子坐标，用B3LYP/3-21G基组构建好Gaussian计算文件；

2、采用Gaussian计算上述计算文件；

3、从计算结果中获取理化参数：最高占有轨道能、解离常数pKa、极化率、偶极矩、分子体积、吉布斯自由能和分子最高-低轨道占有能差E_h-l。

4.如权利要求1所述的预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：所述获取受体蛋白及构建其同源模型，具体包括以下步骤：

1、获取受体蛋白的基因序列；

2、获取大肠杆菌中该受体蛋白的晶体结构；

3、将步骤2中的晶体结构与受体蛋白的基因序列作序列对比，获取两者的相似度和一致性；

4、根据步骤3中两者的相似度和一致性，建立同源模型；

5、基于拉氏图结果选定该同源模型中的不匹配区域，对所建同源模型进行优化，直至评价分数不再有变化。

5.如权利要求4所述的预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：所述受体蛋白所在的受试生物为明亮发光杆菌。

6.如权利要求1所述的预测抗生素类污染物联合慢性毒性的方法，其特征在于：所述测定抗生素与受体蛋白的相互结合能，具体包括以下步骤：

1、对所建同源模型加Charm力场；

2、选择构建同源模型的受体蛋白为受体，根据大肠杆菌中的相应配体结合位置选定结合区域；

3、进行抗生素与受体蛋白的对接；

4、对接结束后，获取抗生素与受体蛋白的相互结合能。