[发明专利]用于鉴别原发起源不明的癌的起源的方法和材料

权利要求书

1.鉴别起源不明转移灶的起源的方法，其包括下列步骤

a.获得含有转移细胞的样品；

b.测量与至少2种不同癌有关的生物标记；

c.将来自所述生物标记的数据组合进线性判别分析中，其中所述 线性判别分析

i.相对于参比标准化所述生物标记；和

ii.施加优化各生物标记的灵敏度和特异性的截止值，对癌的 患病率加权并选择起源组织；

d.根据通过线性判别分析确定的最高概率来确定起源，或确定该 癌不是源自特定癌集合；和

e.任选地测量一种或多种其它不同癌的特异性生物标记，并为其 它生物标记重复步骤c)和d)。

2.权利要求1的方法，其中所述标记基因选自与下述相对应的组 中的至少一种：

i.SP-B、TTF、DSG3、KRT6F、p73H或SFTPC；

ii.F5、PSCA、ITGB6、KLK10、CLDN18、TR10或FKBP10；或

iii.CDH17、CDX1或FABP1。

3.权利要求2的方法，其中所述标记基因是SP-B、TTF、DSG3、 KRT6F、p73H或SFTPC。

4.权利要求3的方法，其中所述标记基因是SP-B、TTF和DSG3。

5.权利要求4的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， KRT6F、p73H和/或SFTPC。

6.权利要求2的方法，其中所述标记基因是F5、PSCA、ITGB6、 KLK10、CLDN18、TR10或FKBP10。

7.权利要求6的方法，其中所述标记基因是F5和PSCA。

8.权利要求7的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， ITGB6、KLK10、CLDN18、TR10和/或FKBP10。

9.权利要求1的方法，其中所述标记基因是CDH17、CDX1或 FABP1。

10.权利要求9的方法，其中所述标记基因是CDH17。

11.权利要求10的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， CDX1和/或FABP1。

12.权利要求1-11之一的方法，其中使用SEQ ID NO：11-58中的 至少一种测量基因表达。

13.权利要求2的方法，其中所述标记基因还选自性别特异性标 记，所述性别特异性标记选自下述至少一种

i.在男性患者的情况下，KLK3、KLK2、NGEP或NPY；或

ii.在女性患者的情况下，PDEF、MGB、PIP、B305D、B726或 GABA-Pi；和/或WT1、PAX8、STAR或EMX2。

14.权利要求13的方法，其中所述标记基因是KLK2。

15.权利要求14的方法，其中所述标记基因是KLK3。

16.权利要求15的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， NGEP和/或NPY。

17.权利要求13的方法，其中所述标记基因是PDEF、MGB、PIP、 B305D、B726或GABA-Pi。

18.权利要求17的方法，其中所述标记基因是PDEF和MGB。

19.权利要求18的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， PIP、B305D、B726或GABA-Pi。

20.权利要求13的方法，其中所述标记基因是WT1、PAX8、STAR 或EMX2。

21.权利要求20的方法，其中所述标记基因是WT1。

22.权利要求21的方法，其中所述标记基因还包括，或被替换为， PAX8、STAR或EMX2。