[发明专利]一种新的多肽——剪接因子SF3a6011.11和编码这种多肽的多核苷酸无效
申请号: | 00127642.5 | 申请日: | 2000-12-01 |
公开(公告)号: | CN1355229A | 公开(公告)日: | 2002-06-26 |
发明(设计)人: | 毛裕民;谢毅 | 申请(专利权)人: | 复旦大学;上海博道基因技术有限公司 |
主分类号: | C07K14/435 | 分类号: | C07K14/435;C07K14/00;C07K16/18;C07K16/00;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/16;A61K38/17;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 陆飞,姚静芳 |
地址: | 20043*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多肽 剪接 因子 sf3a6011 11 编码 这种 多核苷酸 | ||
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——剪接因子SF3a6011.11,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。
在前体mRNA剪接内含子的两步转酯作用反应可能是被RNA催化的[Madhani,H.D.and Guthrie,C.(1994)Annu.Rev.Genet.,28,1-26]。剪接发生在一个大的核糖核蛋白微粒中,剪接体聚集在许多参与发生在前体mRNA,小核仁核糖核蛋白微粒(snRNPs)和非小核仁核糖核蛋白因子之间的动态反应步骤中。
哺乳动物参与前体mRNA剪接的snRNPs由相对较短的RNA分子(snRNAs)和几种蛋白组成。这几种蛋白可以分为三类:(1)所有
snRNPs都含有的Sm蛋白(2)组成蛋白颗粒有自己的特征,但蛋白之间又是紧密连接的(3)与其他蛋白没有连接的单独的蛋白。U1 snRNPs结合5’剪接位点从而在剪接复合体E中形成第一个特异性媒介。U2 snRNPs与前体mRNA分支位点结合产生前体剪接复合体A。接下来是U4/U6.U5 snRNPs结合形成复合体B。通过结构识别激活剪接复合体C再通过两次转酯反应产生RNA。
除了少数几种蛋白,几乎所有哺乳动物的剪接蛋白都参与剪接复合体积聚的早期过程。剪接因子SR蛋白家族成员与U1 snRNPs在前体mRNA剪接途径中所起作用是一样的。至少有四个剪接因子组成剪接复合体A,其中就有三种就是SR蛋白家族的成员。三个SR蛋白家族成员之一是SR3a剪接因子。
SR3a剪接因子是一个寡聚蛋白,它包括一个分子量为60kDa的亚基SR3a60。有证据表明SR3a60与剪接复合体相关蛋白SAP61是同一个蛋白,与酵母的PRP9蛋白在结构上相关并且都在前体剪接复合体A中起作用。这两个蛋白在结构上有大约30%的相同性,其中同源性最高的地方在于C末端,可能包括一个C2H2型锌指蛋白基元。
通过基因芯片的分析发现,在正常脑、肝癌、肌肉、胎脑、胎肾,胎肺、胎肝、甲状腺、胸腺、成人肝、肺、胶质瘤中,本发明的多肽的表达谱与剪接因子SF3a60的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为剪接因子SF3a6011.11。
由于如上所述剪接因子SF3a6011.11蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的剪接因子SF3a6011.11蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新剪接因子SF3a6011.11蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。
本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——剪接因子SF3a6011.11以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。
本发明的另一个目的是提供含有编码剪接因子SF3a6011.11的多核苷酸的重组载体。
本发明的另一个目的是提供含有编码剪接因子SF3a6011.11的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。
本发明的另一个目的是提供生产剪接因子SF3a6011.11的方法。
本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——剪接因子SF3a6011.11的抗体。
本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——剪接因子SF3a6011.11的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。
本发明的另一个目的是提供诊断治疗与剪接因子SF3a6011.11异常相关的疾病的方法。
本发明涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含:具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。
本发明还涉及一种分离的多核苷酸,它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体:
(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸;
(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。
更佳地,该多核苷酸的序列是选自下组的一种:(a)具有SEQ ID NO:1中17-322位的序列;和(b)具有SEQ ID NO:1中1-1876位的序列。
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