本发明提供了一种与番茄黄化卷叶病毒Ty-2抗性基因紧密连锁的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明筛选出与Ty-2基因连锁的SCAR标记，可以有效的用于Ty-2基因的标记辅助选择，所述分子标记与番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty-2的紧密连锁距离为2.2cM。以该标记为路标，可以进行Ty-2基因的精细定位或通过染色体步移法接近Ty-2基因，从而为Ty-2基因的克隆打下基础。
本发明属于生物技术领域，特别涉及番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty‑2的共显性SCAR分子标记的特异性引物及其应用。该抗性基因Ty‑2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明筛选出Ty‑2基因的SCAR标记，可以有效的用于Ty‑2基因的标记辅助选择，所述分子标记为番茄黄化卷叶病毒抗性基因Ty‑2的分子标记。该标记提高选择的准确性，缩短育种年限，同时也为Ty‑2基因的功能研究打下基础。
本发明涉及一种基于番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty‑3的InDel标记，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明还涉及一种扩增基于番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty‑3的InDel标记的引物对，该引物对序列如下：正向引物序列：5’‑TGCAGGAACAGAATGATAGAAAA‑3’；反向引物序列：5’‑GCTCAGCATCACCTGAGACA本发明的分子标记完全基于番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty‑3。本发明开发出基于黄化曲叶病毒病抗性基因Ty‑3的InDel标记，该标记完全基于抗性基因Ty‑3，与Ty‑3基因完全连锁，为共显性分子标记。将该标记用于黄化曲叶病毒病抗性基因Ty‑3的分子标记辅助选择，可大幅提高选择的准确性，缩短育种年限，从而加速育种进程。
