本发明属于分子生物学领域,涉及一种分子标记,具体涉及一种与谷子刚毛颜色基因紧密连锁的分子标记,该分子标记含有Seq ID No.1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在谷子刚毛颜色基因定位或谷子遗传育种中的用途,以及一种谷子育种方法。本发明的分子标记将基因组DNA序列与谷子刚毛颜色基因联系起来,有利于谷子分子标记辅助育种体系的建立;所述分子标记与谷子刚毛颜色基因的遗传紧密连锁距离为0.5cM。本发明的分子标记及分子标记扩增引物可以简便、快速、高通量地应用于谷子育种实践和资源及品种鉴定。