本发明公开了一种谷梅4号抗稻瘟病基因Pigm的分子标记及其应用。所述分子标记包括谷梅4号特异性分子标记Pigm‑4,所述的分子标记Pigm‑4为涵括位于水稻日本晴基因组第6号染色体10436119bp~10436192bp处存在差异的DNA片段,而谷梅4号此段序列缺失,Pigm‑4引物对的上、下游引物分别如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。Pigm基因上游分子标记引物对Pigm‑2的上、下游引物分别如SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示。
与水稻稻瘟病抗性基因Pigm紧密连锁的分子标记R060939。本发明提供了一种与水稻稻瘟病抗性基因Pigm紧密连锁的分子标记,该分子标记含有SEQ ID NO:1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻稻瘟病抗性基因Pigm定位或水稻遗传育种中的用途,以及一种水稻育种方法。本发明的分子标记将基因组DNA序列与水稻稻瘟病抗性基因Pigm联系起来,有利于水稻分子标记辅助育种体系的建立;所述分子标记与水稻稻瘟病抗性基因Pigm紧密连锁。
本发明提供了一种稻瘟病抗性基因Pigm功能特异性分子标记及其应用,是通过引物对SEQ ID NO.1‑2从水稻基因组DNA中扩增出与稻瘟病抗性基因Pigm呈特异性带型的分子标记。本发明所提供的稻瘟病抗性基因Pigm基因特异性分子标记具有重要的应用价值,利用此标记可以提高该基因在种质资源筛选、分子标记辅助选择育种、基因聚合育种,以及转基因育种中利用的效率。
本发明提供了一种水稻抗稻瘟病基因Pigm的荧光分子标记及其引物,其引物包括Allele‑T引物、Allele‑C引物和Common‑R引物,所述Allele‑T引物的序列如SEQ ID NO:1所示,所述采用本发明的技术方案的荧光分子标记,实现了快速检测水稻品种中是否含有抗稻瘟病等位基因Pigm;方法简单可靠,解决了目前使用的方法存在效率低,使用有毒物质的缺点,可应用在水稻抗稻瘟病Pigm等位基因的检测和