本发明涉及一种花姬蛙抗菌肽及其基因和在制药中的应用,所述花姬蛙抗菌肽由30个氨基酸组成的一种环状多肽,分子量3440.53道尔顿,等电点10.726,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,上述多肽的其第三半胱氨酸和第七位半胱氨酸相成分子内二硫键所述花姬蛙抗菌肽的基因序列由SEQ ID NO.4组成,其中编码有功能的成熟花姬蛙抗菌肽是第370‑459位核苷酸。本发明由花姬蛙抗菌肽的基因推导其成熟功能多肽氨基酸序列,合成的花姬蛙抗菌肽具有很强的抗菌和免疫调节功能。该花姬蛙抗菌肽具有结构简单、人工合成方便的特点,可以作为制备病原微生物感染性疾病的治疗药物应用。