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[发明专利]基于杂交兰转录组开发的EST-SSR标记引物及应用-CN201811386384.X有效
发明人：钟淮钦;林榕燕;林兵;罗远华;樊荣辉;吴建设;叶秀仙;方能炎 -专利权人：福建省农业科学院作物研究所
申请日： 2018-11-20 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了9组引物对，以及杂交兰EST‑SSR引物的筛选方法，具体包括：获取目标杂交兰叶片的原始基因数据库、对原始基因数据库进行SSR位点搜索、Primer 5.0对目标序列进行PCR引物设计，并生成候选引物
基于杂交转录开发 est ssr 标记引物应用

[发明专利]构建皮肤相关基因标准型别数据库的方法及应用-CN201711273051.1有效
发明人：胡晶晶;刘忠军;陈祝;常雯婷;徐际超;许嘉祺;叶睿;杜乐 -专利权人：懿奈(上海)生物科技有限公司
申请日： 2017-12-06 - 公布日： 2021-04-13 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明属于基因检测技术领域，公开了一种构建皮肤相关基因标准型别数据库的方法及应用，包含：提取样本基因组DNA进行基因测序；对基因测序数据进行分析，得到样本基因型数据；整理公共基因数据库中皮肤相关基因位点并进行权重分配；将样本基因型数据与皮肤相关基因位点的权重分配数据比对，得到样本特有的皮肤相关基因信息；根据样本特有的皮肤相关基因信息建立打分模型，对基因位点突变导致的表型发生的概率进行打分；以基因型数据、样本特有的皮肤相关基因信息和基因位点突变导致的表型发生的概率分值，构建皮肤相关基因标准型别数据库。本发明所构建的数据库为皮肤基因研究奠定基础、促进个性化皮肤护理的发展。
构建皮肤相关基因标准型数据库方法应用

[发明专利]基因组数据的重新识别的前摄抗性-CN201880077701.1在审
发明人：屈劲;夏伏彪;毛勇;A·R·曼科维赫;R·J·克拉辛斯基 -专利权人：皇家飞利浦有限公司
申请日： 2018-11-30 - 公布日： 2020-07-17 - 主分类号： G16H10/60 文献下载
摘要：一种用于评估与来自调查者的请求相关联的风险的方法(100)，所述请求是针对来自基因数据的数据库(242)的等位基因频率的，所述方法包括：(i)生成(120)等位基因数据库(280)，其包括针对多个等位基因中每个的等位基因频率信息和请求频率信息；(ii)生成(130)调查者数据库(290)，其包括关于多个调查者的等位基因请求信息；(iii)接收(140)来自调查者的针对基因数据的请求，包括针对一个或多个等位基因的等位基因频率的请求和所述调查者的标识符；(iv)基于接收到的请求来更新(150)请求频率信息；(v)更新(160)针对请求调查者的等位基因请求信息；(vi)计算(170)等位基因风险评分；(vii)计算(180)调查者风险评分；并且(viii)基于所述等位基因风险评分和所述调查者风险评分来评估(190)与接收到的请求相关联的风险。
基因组数据重新识别抗性

[发明专利]一种基于基因序列相似的病毒源头筛选方法-CN202010551838.5在审
发明人：刘杨;刘子超 -专利权人：昆明理工大学
申请日： 2020-06-17 - 公布日： 2020-11-06 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于基因序列相似的病毒源头筛选方法，属于生物基因数据处理技术领域。本发明先获取目前已知病毒的基因序列及其对应的病毒源头信息，组建病毒基因数据库；接着对病毒基因序列进行切片，得到基因片段；对待测病毒基因序列也按照相同切片手段切割成若干基因片段，根据基因序列相似算法在数据库中检索其相似的病毒基因片段
一种基于基因序列相似病毒源头筛选方法

[发明专利]莱茵衣藻油脂代谢基因CrDGAT2-5及其编码蛋白与应用-CN201110276683.X无效
发明人：邓晓东;费小雯;辜博;罗秋兰 -专利权人：中国热带农业科学院热带生物技术研究所
申请日： 2011-09-16 - 公布日： 2012-01-18 - 主分类号： C12N15/54 文献下载
摘要：本发明涉及一种莱茵衣藻油脂代谢基因CrDGAT2-5及其编码蛋白与应用，所述莱茵衣藻油脂代谢基因CrDGAT2-5是以JGI莱茵衣藻基因数据库公布的au.g4218_t1基因为模板进行扩增cDNA获得，其序列如SEQ ID NO：1所示的核苷酸；其编码蛋白是根据其碱基序列分析而推测编码CrDGAT2-5蛋白质序列，其序列如SEQ ID NO：2所示的氨基酸残基序列的蛋白质；将该基因运用于莱茵衣藻进行植物表达可以显著提高莱茵衣藻中中性脂含量和生物量本发明以JGI莱茵衣藻基因数据库公布的au.g4218_t1基因为模板进行扩增cDNA获得莱茵衣藻油脂代谢基因CrDGAT2-5，运用于莱茵衣藻中可以显著提高中性脂含量和生物量，对提高微藻含油量以及品质具有重要意义
莱茵衣藻油脂代谢基因 crdgat2 及其编码蛋白应用

[发明专利]一种基因组数据的处理方法、系统及装置-CN201911114957.8在审
发明人：余欢;苏庆东;李瑞强;陈明;李莉;郑琪 -专利权人：北京诺禾致源科技股份有限公司;天津诺禾致源生物信息科技有限公司;天津诺禾医学检验所有限公司
申请日： 2019-11-14 - 公布日： 2020-04-10 - 主分类号： G16B50/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基因组数据的处理方法、系统及装置。其中，该方法包括：读取基因文件，其中，基因文件的类型包括如下至少之一：VCF文件、注释后的TSV文件或注释后的VCF文件；按照基因文件的类型，将基因文件存储到基因组数据库中；在服务器中成功部署配置文件的情况下，将应用程序解压到服务器的网页根目录下，其中，服务器的配置文件包括：访问端口和网页根目录，然后配置应用程序连接数据库。本发明解决了目前无法对自己构建的基因数据库进行方便地操作的技术问题。
一种基因组数据处理方法系统装置

[发明专利]一种生命科学计算容器包系统及方法-CN201910896021.9在审
发明人：周会群;王玲 -专利权人：南京信易达计算技术有限公司
申请日： 2019-09-22 - 公布日： 2020-01-21 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：其包括基因数据采集模块、基因数据分析模块和数据计算容器包，所述基因数据分析模块包括序列数据挖掘模块和序列数据聚类模块，所述序列数据挖掘模块用于对序列数据进行挖掘，所述序列数据聚类模块用于对序列数据进行聚类分析该生命科学计算容器包系统及方法中，能够全方位记录基因数据信息，建立完整的基因数据库，实现序列数据的深度挖掘，并提取序列数据中的重要数据，采用序列数据聚类模块，将序列数据的集合分组为由类似的对象组成的多个类并进行分析
序列数据基因数据计算容器聚类模块挖掘分析模块生命科学包系统基因数据库采集模块对象组成固有结构聚类分析数据计算重要数据容器包集合种群分组记录分析

[发明专利]一种辣椒抗病基因鉴定方法-CN201610461937.8在审
发明人：宋虎卫;罗德旭;王新风;胡卫成;沈婷;强倩 -专利权人：淮阴师范学院
申请日： 2016-06-23 - 公布日： 2018-01-09 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种辣椒抗疫病基因鉴定方法，包括以下步骤S1供试抗疫病辣椒品种的筛选与育苗；S2带有荧光标记毒素疫菌的准备；S3采取辣椒壮苗叶片，用带有荧光标记毒素的疫菌进行全叶离体接种；S4对接种后含有荧光标记毒素的不同品种辣椒叶片提取DNA并进行测序，同时通过关联分析法确立辣椒抗疫病荧光标记毒素鉴定与辣椒抗疫病基因片段之间对应关系，将辣椒DNA片段建成辣椒抗疫病基因数据库；S5将待检测辣椒DNA序列与上述辣椒抗病基因数据库进行Blast比对分析，即可得知待检辣椒品种是否含有抗疫病基因即是否具有抗疫病性能。本发明建立的一种辣椒抗疫病基因鉴定方法，鉴定结果准确可靠直观，操作简便，鉴定所需时间短，人力物力耗费少，对环境生态友好。
一种辣椒抗病基因鉴定方法

[发明专利]一种焦炭基因库的建立方法及其应用-CN201810150215.X在审
发明人：王炜;戴柏秋;徐润生;杨代伟 -专利权人：武汉科技大学
申请日： 2018-02-13 - 公布日： 2018-09-07 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明属于冶金化工技术领域，具体涉及一种焦炭基因库的建立方法及其应用。焦炭基因库的建立方法包括以下步骤：1)获取具有不同成分信息的焦炭样品；2)分别获取各焦炭样品的焦炭样品基因信息，所述焦炭样品基因信息包括：该焦炭样品的微观信息；该焦炭样品的介观信息；该焦炭样品的宏观信息；3)建立包括各焦炭样品的成分信息和各焦炭样品对应的焦炭样品基因信息的对应关系的数据库，得到焦炭基因库。该方法可以建立焦炭成分—结构—性能之间的内在联系，以便于更好地预测与分析焦炭的性能，可弥补现有材料基因数据库的空缺。
焦炭基因库样品基因成分信息基因数据库宏观信息内在联系微观信息冶金化工应用数据库空缺预测分析

[发明专利]基于RNA-seq数据的肿瘤基因突变检测方法及系统-CN201810632056.7在审
发明人：黄金艳;李剑峰 -专利权人：上海交通大学医学院附属瑞金医院
申请日： 2018-06-19 - 公布日： 2019-07-16 - 主分类号： G16B20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于RNA‑seq数据的肿瘤基因突变检测方法，包括以下步骤：收集并分别整理出不同肿瘤、疾病高发的基因突变，建立一个高优先级突变检测的基因列表及突变位点数据库；收集并整理出目前已经具有明确的靶向或化疗药物作用位点的基因突变及基因数据库；建立基于RNA‑seq的基因突变注释数据库；收集整理出用于RNA‑seq突变检测的质量控制、基因序列比对、基因突变检测算法；建立一套完整的从原始RNA‑seq测序数据到最后突变检测结果的分析流程；还公开了基于RNA‑seq数据的肿瘤基因突变检测系统。通过使用整合的多个数据库，通过检测分析流程人们可以更加快速的找到已知的与肿瘤发生相关的基因突变位点。
突变检测基因突变肿瘤基因基因突变检测基因突变位点多个数据库基因数据库注释数据库测序数据分析流程化疗药物基因序列检测分析突变位点肿瘤发生作用位点质量控制靶向比对整合算法数据库肿瘤基因疾病

[发明专利]一种药物活性的预测方法及其应用-CN201710769899.7有效
发明人：张红雨;全源;朱丽达;李姜;柳叶茂;杨庆勇;黄清 -专利权人：武汉百药联科科技有限公司;华中农业大学
申请日： 2017-08-31 - 公布日： 2020-01-21 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明所述药物活性的预测方法包括以下步骤：1)通过查询药物靶标互作关系数据库信息，收集人类上市或者在研药物的靶标及其治疗活性信息；2)查找多个致病基因数据库，收集疾病关联基因，根据疾病关联基因的对应药物的有活性率，给予不同数据库来源的疾病关联基因不同的赋分；3)构建药物靶标与疾病关联基因的特征属性；4)构建机器学习预测模型；5)对模型预测效果进行评估；6)预测针对特定疾病有活性的药物。本发明提供的药物活性的预测方法能够作为药物发现领域的GPS，高效识别疾病关联基因，为活性药物的预测研发提供有效指导，并为未来药物发现领域提供全新的方法和思路。
一种药物活性预测方法及其应用

[发明专利]一种基于纳米孔测序靶向富集细菌16S rRNA基因的测序方法-CN202210942978.4在审
发明人：廖玉辉;周家健;张卉;孙航;付钰;舒博文;杨德龙 -专利权人：南方医科大学皮肤病医院（广东省皮肤病医院、广东省皮肤性病防治中心、中国麻风防治研究中心）
申请日： 2022-08-08 - 公布日： 2022-10-25 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明专利公开了一种基于纳米孔测序靶向富集细菌16S rRNA基因的测序方法，其方法包括如下步骤：提取临床样本中的总基因组、总基因组末端去磷酸化封闭、通用sgRNA靶向酶切病原细菌微生物16S rRNA基因组保守序列、选择性在酶切位点添加A黏性末端尾巴、并连接测序接头、根据测序数据与基因数据库进行序列对比，得到待鉴定细菌的菌种；本发明专利使用了稳定16S rRNA的V2‑V3保守基因进行靶向富集，以V2‑V3为测序起点，检测获得16S rRNA两端基因覆盖率更高，检测范围更广，分类结果更可信，本发明特异性靶向细菌16S rRNA基因建库，有效避免了宿主基因组的干扰，降低背景宿主的人源比例，提高病原体检测灵敏度和检出效率
一种基于纳米孔测序靶向富集细菌 16 rrna 基因方法

[发明专利]用于计算机上的疾病基因相关药物发掘系统-CN201010240610.0无效
发明人：陈越 -专利权人：陈越
申请日： 2010-07-30 - 公布日： 2011-03-23 - 主分类号： G06F17/30 文献下载
摘要：一种基于计算机上与疾病基因相关的药物发掘系统的生成方法和系统。系统包括后端数据存贮服务器，可连接位于因特网或局域网上的生物医学文本数据库服务器，疾病相关基因数据库服务器，及基因或蛋白质相互作用关系数据库。后端数据存贮服务器连接前端的查询服务器，可对用户感兴趣的疾病在现有的数据库资料中进行查询和统计分析，并存储与疾病(致病或易感)基因最相关的蛋白质，与疾病基因最相关的生化药物，和与疾病基因最相关的蛋白质-系统还可用来发现并比较设计药物分子机理或毒理，或辅助定向生成小分子化学药物筛选库。
用于计算机疾病基因相关药物发掘系统

[发明专利]一种烧结矿基因库的建立方法及其应用-CN201810150216.4在审
发明人：王炜;杨代伟;徐润生 -专利权人：武汉科技大学
申请日： 2018-02-13 - 公布日： 2018-09-04 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明属于冶金化工技术领域，具体涉及一种烧结矿基因库的建立方法及其应用。烧结矿基因库的建立方法包括以下步骤：1)获取具有不同成分信息的烧结矿样品；2)分别获取各烧结矿样品的烧结矿样品基因信息，所述烧结矿样品基因信息包括：该烧结矿样品的微观信息；该烧结矿样品的介观信息；该烧结矿样品的宏观信息；3)建立包括各烧结矿样品的成分信息和各烧结矿样品对应的烧结矿样品基因信息的对应关系的数据库，得到烧结矿基因库。该方法可以建立烧结矿成分—结构—性能之间的内在联系，以便于更好地预测与分析烧结矿的性能，可弥补材料基因数据库的空缺。
烧结矿基因库样品基因成分信息基因数据库宏观信息内在联系微观信息冶金化工空缺应用数据库预测分析

[发明专利]下一代测序分析系统及其下一代测序分析方法-CN201410748830.2在审
发明人：郑少桦;邱育贤;庄曜宇;卢子彬;董恒元 -专利权人：财团法人资讯工业策进会
申请日： 2014-12-09 - 公布日： 2016-07-06 - 主分类号： C12M1/00 文献下载
摘要：下一代测序分析系统接收一目标基因输入，并根据基因数据库的基因关联数据，决定目标基因输入的至少一基因群组。下一代测序分析系统根据至少一基因群组，将标准基因参考序列调整为特征基因参考序列，并将待测基因片段数据与特征基因参考序列进行比对，以分析待测基因片段数据与特征基因参考序列的基因变异率。
下一代分析系统及其方法