本发明公开了一种与黄羽肉鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述分子标记的突变位于其第七外显子g.8419598 CT处。本发明发现由于DKK3基因启动子区域突变影响黄羽肉鸡的腹脂性状。因此,所述本发明分子标记方法可应用于选育腹脂沉积比较少的个体,剔除鸡腹脂沉积严重的个体,提取待检测黄羽肉鸡的DNA,通过目的片段的获得及测序利用正反向引物对通过PCR扩增待测鸡的DNA,将获得的产物进行测序所述分子标记有利于选育优势杂合基因型CT型黄羽肉鸡,减少鸡的腹脂沉积。