本发明涉及一种用于区分羽衣甘蓝表皮蜡质性状的分子标记,所述分子标记为酶切扩增多态性序列(CAPS),所述酶切扩增多态性序列(CAPS)的原始序列的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1,下游引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:2,所述分子标记区分羽衣甘蓝表皮蜡质性状的应用方法包括如下步骤:(1)提取羽衣甘蓝基因组DNA;(2)所述分子标记PCR扩增;(3)限制性内切酶NcoⅠ酶切PCR产物;(4)琼脂糖凝胶电泳检测本发明建立了一种应用CAPS分子标记在羽衣甘蓝任意发育时期区分表皮蜡质性状的方法,在羽衣甘蓝表皮蜡质鉴定与新品种选育方面具有重要的科学指导意义。