本发明提供了一种快速鉴定南方鲇、鲇和其杂交种的特异分子标记、引物及试剂盒，所述引物序列如SEQID：No.1和SEQID：No.2所示；所述特异分子标记位于基因gsdf的第二个外显子到第三个外显子区域，南方鲇的该分子标记长度为595 bp，核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，鲇的该分子标记长度为522 bp，核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。本发明鉴定过程仅需剪取少量鳍条，提取基因组DNA，使用该引物进行PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳即可；同时准确率高，不受制于鱼体的生长情况，可在各养殖阶段取样鉴定。可广泛应用于科研及推广单位、苗种繁育场及养殖商户，一方面可用于鉴别三种鲇鱼（南方鲇、鲇和其杂交种）苗种，另一方面，可用于南方鲇、鲇和其杂交种的种质标准制定。
本发明公开了一种胡子鲇性别特异性分子标记引物，该引物为引物NP544，引物NP544包括正向引物NP544‑F和反向引物NP544‑R，碱基序列分别如SEQ ID NO：1所示和SEQ ID NO：2所示还公开了用于胡子鲇性别鉴定的试剂盒和方法，及上述引物或试剂盒和方法在鉴定胡子鲇性别方面的应用。该引物特异性好，准确性高，对胡子鲇活体没有伤害，可一次性快速准确批量鉴定胡子鲇的性别，具有重要的科研和应用价值。
