本发明涉及一种实现终端设备自启动的方法及系统,所述方法为:计算机检测到有终端设备接入并上报成USB Mass Storage设备后,判断所述终端设备的过滤驱动是否已安装并加载,若是,则直接通知所述终端设备切换到用户可用端口;否则,通知所述终端设备上报成CD-ROM,依次安装并加载所述终端设备的过滤驱动和/或应用程序以及设备驱动,然后通知所述终端设备切换到用户可用端口;所述终端设备接收到端口切换通知后,进行复位并重新枚举,然后切换到用户可用端口;所述系统包括计算机和终端设备。本发明减少了用户的等待时间,提高了设备的易用性。