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[发明专利]评价方法、评价程序和评价装置-CN201980096262.3在审
发明人：片冈正弘;松村量;茂栉薰 -专利权人：富士通株式会社
申请日： 2019-05-13 - 公布日： 2021-12-17 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：评价装置通过移位而生成新的碱基序列数据。评价装置确定通过将新的碱基序列数据中所含的多个碱基从新的碱基序列数据上的基准位置以规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的碱基的部分碱基序列。评价装置根据在所确定的部分碱基序列以及多个部分碱基序列中的与所确定的部分碱基序列具有规定的位置关系的部分碱基序列的排列在通过将规定的碱基序列数据中所含的多个碱基从规定的碱基序列数据上的基准位置以规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中出现的出现状况进行评价
评价方法程序装置

[发明专利]基于人工智能的表观遗传-CN202080065003.7在审
发明人： S·卡拉佐普罗潘吉欧托普卢;K-H·法尔 -专利权人：因美纳有限公司
申请日： 2020-09-18 - 公布日： 2022-04-26 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本公开提供了一种基于人工智能的系统，该基于人工智能的系统包括输入准备模块，该输入准备模块访问序列数据库并且生成输入碱基序列。该输入碱基序列包括具有靶向碱基的靶向碱基序列，其中该靶向碱基序列侧接具有下游上下文碱基的右端碱基序列，和具有上游上下文碱基的左端碱基序列。序列对序列模型处理输入碱基序列并且生成输入碱基序列的替代表示。输出模块处理输入碱基序列的该替代表示并且针对靶向碱基序列中的靶向碱基中的每个靶向碱基产生至少一个每碱基输出。该每碱基输出针对对应靶向碱基指定多个表观遗传轨迹的信号水平。
基于人工智能表观遗传

[发明专利]药剂诱导性启动子和使用该启动子的基因表达诱导方法-CN201610439777.7在审
发明人：都筑祥子;西村哲 -专利权人：丰田自动车株式会社
申请日： 2016-06-17 - 公布日： 2017-01-04 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明的解决方法是一种药剂诱导性启动子，包含从3’末端侧到5’末端侧依次具有第1碱基序列、第2碱基序列、第3碱基序列、第4碱基序列和第5碱基序列的多核苷酸，所述第1碱基序列相对于序列号1所示的碱基序列有90％以上的同一性，所述第2碱基序列相对于序列号2所示的碱基序列有90％以上的同一性，所述第3碱基序列相对于序列号3所示的碱基序列有90％以上的同一性，所述第4碱基序列相对于序列号4所示的碱基序列有90％以上的同一性，所述第5碱基序列相对于序列号5所示的碱基序列有90％以上的同一性。
药剂诱导性启动子使用基因表达诱导方法

[发明专利]一种基于碱基序列分析物种的方法及装置-CN202210326419.0在审
发明人：张优劲;王泰福;夏世强;杨姣博;王学斌;谢植豪;贺增泉 -专利权人：深圳华大医学检验实验室
申请日： 2022-03-30 - 公布日： 2022-07-12 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于碱基序列分析物种的方法及装置，所述方法包括：获取待检测基因序列，读取待检测基因序列，得到若干待分析碱基序列，在物种碱基序列库中确定与待分析碱基序列匹配的若干目标碱基序列，以及每个目标碱基序列对应的若干物种信息，确定物种信息与待分析碱基序列的匹配得分，统计物种信息的出现频率，从而得到待分析碱基序列的归属物种的概率得分，概率得分最高者作为归属物种。可见，在比对时分析两碱基序列的相似度，对与待分析碱基序列对应的物种信息打分，结合物种信息的出现频率，分析待分析碱基序列归属物种的可能性，更科学、精确地衡量待分析碱基序列在各物种中的概率分布，有助于判断待检测基因序列的物种归属
一种基于碱基序列分析物种方法装置

[发明专利]传染性病原体检测用探针和探针组以及载体和基因检查方法-CN200910224930.4有效
发明人：山本伸子;小仓真哉;川口正浩;塚田护;吉井裕人;铃木智博;石井美绘;福井寿文 -专利权人：佳能株式会社
申请日： 2004-04-02 - 公布日： 2010-07-07 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种检测传染性病原体基因的传染性病原体检测用探针组，其中包括由具有从下列各组序列选择出的碱基序列的寡核苷酸形成的多种探针：包含SEQ ID No.1～14碱基序列及其互补序列的第1组、包含SEQ ID No.15～24碱基序列及其互补序列的第2组、包含SEQ IDNo.25～36碱基序列及其互补序列的第3组、包含SEQ ID No.37～47碱基序列以及其互补序列的第4组、包含SEQ ID No.48～57碱基序列及其互补序列的第5组、包含SEQ ID No.58～68碱基序列及其互补序列的第6组、包含SEQ ID No.69～77碱基序列及其互补序列的第7组、包含SEQ ID No.78～85碱基序列及其互补序列的第8组、包含SEQ ID No.86～97碱基序列及其互补序列的第9组、包含SEQ IDNo.98～106碱基序列及其互补序列的第10组。
传染性病原体检测探针以及载体基因检查方法

[发明专利]传染性病原体检测用探针和探针组以及载体和基因检查方法-CN200410033372.0无效
发明人：山本伸子;小仓真哉;川口正浩;塚田护;吉井裕人;铃木智博;石井美绘;福井寿文 -专利权人：佳能株式会社
申请日： 2004-04-02 - 公布日： 2004-10-27 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：一种检测传染性病原体基因的传染性病原体检测用探针组，其中包括由具有从下列各组序列选择出的碱基序列的寡核苷酸形成的多种探针：包含SEQ ID No.1～14碱基序列及其互补序列的第1组、包含SEQ IDNo.15～24碱基序列及其互补序列的第2组、包含SEQ ID No.25～36碱基序列及其互补序列的第3组、包含SEQ ID No.37～47碱基序列以及其互补序列的第4组、包含SEQ ID No.48～57碱基序列及其互补序列的第5组、包含SEQ ID No.58～68碱基序列及其互补序列的第6组、包含SEQ ID No.69～77碱基序列及其互补序列的第7组、包含SEQ ID No.78～85碱基序列及其互补序列的第8组、包含SEQ ID No.86～97碱基序列及其互补序列的第9组、包含SEQ ID No.98～106碱基序列及其互补序列的第10组。
传染性病原体检测探针以及载体基因检查方法

[发明专利]疾病相关基因的多态性检测用探针及其用途-CN201080008254.8在审
发明人：细见敏也;小森真理子 -专利权人：爱科来株式会社
申请日： 2010-12-07 - 公布日： 2012-01-11 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：(P1)碱基长度为11～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～230的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序号230的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P1’)由与上述(P1)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸；(P2)碱基长度为15～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～234的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序列234的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P2’)由与上述(P2)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸；(P3)碱基长度为17～50个碱基，由与包含序列编号1中碱基序号220～236的碱基序列互补的碱基序列构成，且在5’末端区域具有与上述碱基序列236的碱基互补的碱基的寡核苷酸；(P3’)由与上述(P3)的寡核苷酸互补的碱基序列构成的寡核苷酸。
疾病相关基因多态性检测探针及其用途

[发明专利]用于检测堪萨斯分枝杆菌的引物组、探针、试剂盒及方法-CN201880019552.3有效
发明人：宫本重彦;佐野创太郎;友野润;直原启明;波多宏幸;河合明子 -专利权人：株式会社钟化
申请日： 2018-01-18 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：本发明的引物组包含第1引物和第2引物，所述第1引物包含多核苷酸，所述多核苷酸在3’末端包含与碱基序列A相同或同源的碱基序列A’，所述碱基序列A是堪萨斯分枝杆菌的基因组DNA中的靶点区域的5’末端的部分碱基序列，所述靶点区域包含序列号1、9、11、13、15、2、10、12、14或16所示的第1碱基序列或与第1碱基序列互补的第2碱基序列的全部或一部分，所述第2引物包含多核苷酸，所述多核苷酸在3’末端包含与碱基序列B的互补碱基序列相同或同源的碱基序列B’，所述碱基序列B是所述靶点区域的3’末端的部分碱基序列。
用于检测堪萨斯分枝杆菌引物探针试剂盒方法

[发明专利]用于管理遗传信息的装置和方法-CN201280064817.4在审
发明人：郑喜斗;徐廷瑄;李桓硕 -专利权人：马克罗基因株式会社;首尔大学校产学协力团
申请日： 2012-12-26 - 公布日： 2014-09-03 - 主分类号： G06F19/28 文献下载
摘要：本发明提供一种用于遗传信息管理的装置，该装置将对象的碱基序列和标准碱基序列相比较，以确定最长共同碱基序列，并根据最长共同碱基序列在标准碱基序列上排列对象的碱基序列。所述用于遗传信息管理的装置将所述已排列的碱基序列分割成多个碱基密码组，将多个标识符分别分配给多个碱基密码组，并将多个碱基密码组与相应的标识符相关联地存储到多个存储单元。
用于管理遗传信息装置方法

[发明专利]一种FASTQ文件压缩中的碱基序列编码方法和系统-CN202011016128.9在审
发明人：陈毓新;赵子健;李胜康;龚淳;黄志博;张勇;方林 -专利权人：深圳华大生命科学研究院
申请日： 2020-09-24 - 公布日： 2020-12-18 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明属于生物信息数据处理技术领域，涉及一种FASTQ文件压缩中的碱基序列编码方法和系统，S1对待编码碱基序列的简并碱基信息进行编码；S2判断待编码碱基序列是否存在接头序列，若存在所述接头序列则对所述接头序列进行编码；S3将待编码碱基序列与参考序列进行比对，若所述待编码碱基序列与参考序列比对成功，则将所述待编码碱基序列的比对信息进行编码；S4若所述待编码碱基序列与参考序列比对失败，则对所述待编码碱基序列进行熵编码。其通过尽量降低接头序列、简并碱基、低质量碱基给序列比对和熵编码带来的负面影响，从而提高了比对率和熵编码的压缩率。
一种 fastq 文件压缩中的碱基序列编码方法系统

[发明专利]DNA数据编解码方法、装置、计算机设备及存储介质-CN202310847818.6在审
发明人：聂子昂;王洋;黄小罗;叶可江;须成忠 -专利权人：中国科学院深圳先进技术研究院
申请日： 2023-07-11 - 公布日： 2023-10-10 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：所述方法包括：使用深度优先搜索算法对生成的基础碱基序列进行筛选，得到符合预设条件的基础碱基序列；从所述筛选后的基础碱基序列中选择第一设定数量的基础碱基序列作为二进制数据编码时使用的基础碱基序列并构建映射表，选择第二设定数量的基础碱基序列作为用于替换禁忌序列的替换序列；根据映射表将待编码的二进制数据编码为DNA链的碱基序列，并利用所述替换序列对所述碱基序列中的禁忌序列进行替换。本申请实施例能够将任意的二进制数据编码为碱基序列，生成的碱基序列中不包含过长同聚物及禁忌序列，且GC含量均衡，能够降低自行折叠产生二级结构的概率。
dna 数据解码方法装置计算机设备存储介质

[发明专利]采用原子核外电子运动模型编译基因碱基序列的方法-CN202011225101.0在审
发明人：孙波 -专利权人：孙波
申请日： 2020-11-05 - 公布日： 2021-01-29 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了采用原子核外电子运动模型编译基因碱基序列的方法，以核外电子的运动方式，结合每个电子之间可能会出现的特定关系来编译存储生物体基因碱基序列的信息，其中先编译存储基因的碱基序列信息，然后确定碱基序列，依据碱基互补配对原则，A与T配对，C与G配对；接着对核外电子编译碱基序列信息，同时检测核外电子与碱基序列配对，当核外电子运动编译完成碱基序列后，则核外电子运动发生暂停，暂停后的不同电子空间构象图表示不同的碱基序列所属类别，这样就能达到新类型基因碱基测序的目的。
采用原子核外电子运动模型编译基因碱基序列方法

[发明专利]云环境下基于编辑距离的相似碱基序列查询方法-CN201610289866.8在审
发明人：张世哲;李辉;马建峰;马鑫迪 -专利权人：西安电子科技大学
申请日： 2016-05-04 - 公布日： 2016-09-21 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明公开了一种云环境下基于编辑距离的相似碱基序列查询方法，主要解决云不完全可信时，从云端大量的电子记录中找出相似碱基序列的问题。其实现步骤为：(1)计算用户碱基序列的单字符操作集；(2)聚类；(3)用户碱基序列和聚类中心的哈希映射；(4)计算待查询碱基序列的单字符操作集；(5)待查询序列的哈希映射；(6)选择候选客户端；(7)查找相似碱基序列本发明是将基于编辑距离的相似碱基序列查询方法应用于云环境下，较之传统的相似碱基序列查询方法，具有较好的扩展性和伸缩性，保证云环境下的碱基序列的安全，减少硬件资源的消耗。
环境基于编辑距离相似碱基序列查询方法

[发明专利]1,4丁二醇的制造方法、微生物以及基因-CN201380062813.7无效
发明人：青木裕史;小木户谦;桥本阳子;米田正 -专利权人：昭和电工株式会社
申请日： 2013-11-28 - 公布日： 2015-08-05 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：所述微生物包含(a)具有序列号1的碱基序列的基因；(b)具有在序列号1的碱基序列中缺失、取代或插入了一个或多个碱基且相对于序列号1的碱基序列的同一性为90％以上的碱基序列的基因；(c)与相对于具有序列号1所记载的碱基序列的基因而言具有互补的碱基序列的基因，在严格条件下杂交的基因的任一个基因，并且还包含(d)具有序列号2至9的碱基序列的基因；(e)具有在序列号2至9的碱基序列中缺失、取代或插入了一个或多个碱基且相对于原碱基序列的同一性为90％以上的碱基序列的基因；(f)与相对于具有序列号2至9的碱基序列的基因而言具有互补的碱基序列的基因，在严格条件下杂交的基因的任一个以上基因。
丁二醇制造方法微生物以及基因

[发明专利]甘蔗属植物的黑穗病抗性相关标记及其利用-CN201980044267.1在审
发明人：森昌昭;木村达郎;榎宏征;植田勇助;境垣内岳雄;樽本祐助;田中穰;安达克树;服部太一朗;梅田周;早野美智子 -专利权人：丰田自动车株式会社
申请日： 2019-07-02 - 公布日： 2021-05-04 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：一种甘蔗黑穗病抗性相关标记，包含从甘蔗染色体中夹在序列编号1所示碱基序列与序列编号6所示碱基序列之间的区域、夹在序列编号135所示碱基序列与序列编号143所示碱基序列之间的区域、或夹在序列编号144或145所示碱基序列与序列编号151所示碱基序列之间的区域选择的连续的核酸区域。
甘蔗植物黑穗病抗性相关标记及其利用

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