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[发明专利]一种基于布隆过滤器的锚点筛选方法、装置和计算机设备-CN202111041904.5有效
发明人：张昂;廖湘科;崔英博;杨灿群;黄春;唐滔;彭林;夏泽宇 -专利权人：中国人民解放军国防科技大学
申请日： 2021-09-07 - 公布日： 2022-06-24 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：所述方法包括：根据预先定位到的锚点，选取查询序列和参考序列在两个锚点之间的片段为查询序列片段和参考序列片段，分别对参考序列片段和查询序列片段按照预设长度生成多个连续重叠的子片段，通过预设的多个哈希函数建立索引，将参考序列子片段映射到布隆过滤器的位向量中，再根据索引查询，当查询序列子片段在参考序列中不存在时，判断查询序列子片段未通过筛选；遍历查询序列片段中所有查询序列子片段，统计未通过筛选的查询序列子片段的总数本发明可以提高DNA序列比对的精度和速度。
一种基于过滤器筛选方法装置计算机设备

[发明专利]碱基序列比对系统及方法-CN201310064514.9无效
发明人：朴旻胥;朴商贤;吕润九 -专利权人：三星SDS株式会社;延世大学校产学协力团
申请日： 2013-02-28 - 公布日： 2014-05-14 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明公开一种碱基序列比对系统及方法。本发明一实施例提供的碱基序列比对系统包括：片段序列生成单元，从短片段序列生成多个片段序列；过滤单元，从所生成的多个片段序列构成候补片段序列集合；片段序列扩张单元，计算各个候补片段序列的在对象序列的映射位置的数量，选择所计算的映射位置的数量超过设定的值的片段序列，并对所选择的片段序列的大小进行扩张，直至在对象序列的映射位置的数量变成设定的值以下为止；映射长度计算单元，将对象序列分割为多个区间，并按照各区间分别计算候补片段序列的总映射长度；比对单元，选择所计算的总映射长度为基准值以上的区间，并对所选择的区间执行针对短片段序列的全局比对。
碱基序列系统方法

[发明专利]考虑重复性的碱基序列重组系统及方法-CN201310373186.0在审
发明人：朴旻胥 -专利权人：三星SDS株式会社
申请日： 2013-08-23 - 公布日： 2014-05-14 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明公开一种考虑重复性的碱基序列重组系统及方法。根据本发明一个实施例的碱基序列重组系统包括：片段序列生成单元，用于由短片段（read）生成多个片段（fragment）序列；片段序列长度调整单元，从生成的所述多个片段序列当中选择对象碱基序列上的映射重复数超过设定基准值的片段序列，并调整选择的片段序列的长度，直到所述选择的片段序列的映射重复数达到所述基准值以下；比对单元，利用长度得到调整的所述片段序列执行全局比对（Global alignment）。
考虑重复性碱基序列重组系统方法

[发明专利]一种治疗银屑病的干涉片段及其应用-CN202211023257.X在审
发明人：林艺婷;刘振华;李冰;王刚;刘涛 -专利权人：中国人民解放军空军军医大学
申请日： 2022-08-25 - 公布日： 2023-04-28 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：本发明公开了一种治疗银屑病的干涉片段及其应用，属于干涉片段技术领域，所述干涉片段包括干涉片段一和干涉片段二，所述干涉片段均由正义链和反义链组成，所述干涉片段一的正义链和反义链的核苷酸序列分别为序列1和序列2所示，序列1：“GACUCUUCAAGGAUUAGAATT”，序列2：“UUCUAAUCCUUGAAGAGUCTT”；所述干涉片段二的正义链和反义链的核苷酸序列分别为序列3和序列4所示，序列3“GGCUGUUGGUUGUAUAUUATT”，序列4“UAAUAUACAACCAACAGCCTT”，本发明通过构建干涉片段并利用干涉片段来减轻银屑病的症状，抑制皮肤炎症。
一种治疗银屑病干涉片段及其应用

[发明专利]一种基于活性片段的靶向配体生成方法-CN202310409171.9在审
发明人：李朋勇;章楷豪 -专利权人：西安电子科技大学
申请日： 2023-04-17 - 公布日： 2023-09-15 - 主分类号： G16B15/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于活性片段的靶向配体生成方法，包括片段序列化过程：基于片段化方法和序列化方法处理用于训练的配体分子得到片段序列；模型训练过程：将配体分子片段序列和用于训练的靶点蛋白质氨基酸序列输入至靶向配体分子生成模型，通过片段序列编码器提取配体分子片段序列的分子表征，并通过靶点编码器提取靶点蛋白质氨基酸序列的靶点表征，特征融合后使用片段序列解码器输出片段序列，并优化模型；靶向配体分子生成过程：将目标靶点蛋白质氨基酸序列输入至训练后的模型，通过靶点编码器提取靶点表征，并通过先验网络预测复合物信息并输入到片段序列解码器，输出片段序列，再基于分子重建方法将片段序列重组为靶向配体分子。
一种基于活性片段靶向生成方法

[发明专利]数据序列间关系分析方法、装置、存储介质及电子设备-CN202310108058.7有效
发明人：赵国辉 -专利权人：中国科学院西北生态环境资源研究院
申请日： 2023-02-13 - 公布日： 2023-09-15 - 主分类号： G06N5/01 文献下载
摘要：本申请提供一种数据序列间关系分析方法、装置、存储介质及电子设备，涉及大数据领域。其中，电子设备获取第一数据序列以及第二数据序列；根据第一数据序列与第二数据序列，获得多个片段对的关联指数，根据多个片段对的关联指数，从中选取关联指数最大的目标片段对；根据目标片段对，获得第一数据序列与第二数据序列之间的关联信息由于每个片段对包括第一数据序列的第一序列片段以及第二数据序列的第二序列片段，并且，第一序列片段与第二序列片段分别截取自不同是时间段，因此，能够获得两序列数据之间滞后的关联关系。
数据序列关系分析方法装置存储介质电子设备

[发明专利]一种引物组及其在鉴定马铃薯帚顶病毒中的应用-CN201410076470.6有效
发明人：赵竹;丁小兰;李明福;张永江;许瑾;宋云;何增磊 -专利权人：中国检验检疫科学研究院
申请日： 2014-03-04 - 公布日： 2014-06-04 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明提供了引物组，包括DNA片段-Ⅰ、DNA片段-Ⅱ、DNA片段-Ⅲ和DNA片段-Ⅳ；所述DNA片段-Ⅰ、所述DNA片段-Ⅱ、所述DNA片段-Ⅲ和所述DNA片段-Ⅳ均为单链DNA片段；所述DNA片段-Ⅰ如序列表的序列1所示，所述DNA片段-Ⅱ如序列表的序列2所示，所述DNA片段-Ⅲ如序列表的序列3所示，所述DNA片段-Ⅳ如序列表的序列4所示。
一种引物及其鉴定马铃薯病毒中的应用

[发明专利]辅助鉴定棉花曲叶病毒的引物组合物及其应用-CN201310367183.6有效
发明人：赵竹;李明福;张永江;宋云;许瑾;丁小兰;何增磊 -专利权人：中国检验检疫科学研究院
申请日： 2013-08-21 - 公布日： 2013-12-11 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明提供的引物组合物，由DNA片段-Ⅰ、DNA片段-Ⅱ、DNA片段-Ⅲ、DNA片段-Ⅳ、DNA片段-Ⅴ和所述DNA片段-Ⅴ组成，均为单链DNA片段；所述DNA片段-Ⅰ如序列表的序列1所示，所述DNA片段-Ⅱ如序列表的序列2所示，所述DNA片段-Ⅲ如序列表的序列3所示，所述DNA片段-Ⅳ如序列表的序列4所示，所述DNA片段-Ⅴ如序列表的序列5所示。
辅助鉴定棉花病毒引物组合及其应用

[发明专利]考虑整个短片段的碱基序列比对系统及方法-CN201310373446.4无效
发明人：朴旻胥 -专利权人：三星SDS株式会社
申请日： 2013-08-23 - 公布日： 2014-05-14 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明公开一种考虑整个短片段的碱基序列比对系统及方法。根据本发明一个实施例的碱基序列比对系统包括：片段序列生成单元，用于从短片段序列的整个区间生成一个以上的片段（fragment）序列；比对单元，利用生成的所述片段序列而执行针对所述短片段序列的全局比对（global
考虑整个片段碱基序列系统方法

[发明专利]行人属性识别方法、装置和计算机设备-CN201910495047.2在审
发明人：刘皓 -专利权人：腾讯科技（深圳）有限公司
申请日： 2019-06-10 - 公布日： 2019-09-13 - 主分类号： G06K9/00 文献下载
摘要：本申请涉及一种行人属性识别方法，包括：对行人图像进行下采样生成特征片段序列，将特征片段序列输入第一自注意力模型提取特征片段之间的关系权重，根据关系权重对特征片段序列进行更新，得到第一次更新后的特征片段序列将第一次更新后的特征片段序列输入特征片段与属性注意力模型提取特征片段与属性之间的关系权重，根据关系权重对第一次更新后的特征片段序列进行更新得到第二次更新后的特征片段序列。将第二次更新后的特征片段序列输入第二自注意力模型提取属性之间的关系权重，根据关系权重对第二次更新后的特征片段序列进行更新得到第三次更新后的特征片段序列。根据第三次更新后的特征片段序列进行行人属性识别，获得行人属性识别结果。
特征片段更新权重属性识别注意力模型序列输入提取特征计算机设备下采样图像申请

[发明专利]碱基序列比对系统及方法-CN201310368714.3有效
发明人：朴旻胥 -专利权人：三星SDS株式会社
申请日： 2013-08-22 - 公布日： 2017-03-01 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明公开一种碱基序列比对系统及方法。根据本发明的一个实施例的碱基序列比对系统，包括片段序列生成单元，用于由短片段生成多个片段（fragment）序列；筛选单元，用于构成只包含生成的所述多个片段序列当中与参考序列相匹配的片段序列的候选片段序列集合；映射个数计算单元，将所述参考序列划分为多个区间，并计算所述多个区间各自的所述候选片段序列的总映射个数；比对单元，选择计算出的所述总映射个数为基准个数以上的区间，并对选择的区间执行针对所述短片段的全局比对
碱基序列系统方法

[发明专利]组装基因组序列的方法和装置-CN201110049885.0有效
发明人：韩长磊;陈文彬;张秀清;杨焕明 -专利权人：深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院
申请日： 2011-03-02 - 公布日： 2011-10-05 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种组装基因组序列的方法和装置。其中，该方法包括对长插入片段文库末端测序输出的短片段序列进行过滤以去除不合格的序列；将过滤后的短片段序列与参考基因组序列进行比对；根据比对结果将进行比对的成对短片段序列分为soap reads序列、single reads序列和unmap reads序列，并统计各类序列的数量；利用soap reads序列计算成对比对上的短片段序列在参考基因组序列的同一片段上的距离，并统计各个成对比对上的短片段序列在参考基因组序列上的距离分布；在距离分布满足阈值要求时，利用唯一成对比对上参考基因组序列的不同片段的single reads序列进行基因组序列的组装。
组装基因组序列方法装置

[发明专利]组装基因组序列的方法和系统-CN201410272988.7有效
发明人：詹东亮 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2014-06-18 - 公布日： 2014-09-03 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了一种组装基因组序列的方法和系统，将第二代测序技术所得的高精度短片段序列数据和单分子测序所得的长片段序列数据结合在一起进行基因组序列的组装，提高组装效率和准确率。该方法具体包括：利用第二代测序技术对样品进行测序，获得样品的高精度短片段序列；对获得的高精度短片段序列进行拼接，获得第一拼接序列；利用单分子测序技术对与同样来源的样品进行测序，获得同样来源样品的长片段序列；对获得的长片段序列进行拼接，获得第二拼接序列；将第一拼接序列定位到第二拼接序列上；利用第一拼接序列中的高精度短片段序列对第二拼接序列中的长片段序列进行局部纠错，获得第三拼接序列。
组装基因组序列方法系统

[发明专利]用于处理基因数据的方法和数据处理设备-CN202080087497.9在审
发明人：海克·齐默尔曼;萨宾·穆勒 -专利权人：弗劳恩霍夫应用研究促进协会
申请日： 2020-12-16 - 公布日： 2022-08-12 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：一种用于处理基因数据的方法，该基因数据包括一系列序列元素，该序列元素分别代表生物分子，该方法包括以下步骤：形成(S2)序列片段，其中，每个序列片段都包括所述一系列序列元素的、具有至少两个序列元素的片段长度的区段；将编码函数应用(S3)到该序列片段中的每个上以生成多个加密的片段数据，该加密的片段数据分别配属于该序列片段中的一个；以及存储(S4)该加密的片段数据，其中，实现序列片段的形成，以使得一系列序列元素的区段彼此重叠并且每个序列元素都包含在至少两个序列片段中还描述了一种用于处理基因数据的数据处理设备和一种用于查询数据库的方法，该数据库包含加密的片段数据，该加密的片段数据已利用该用于处理基因数据的方法被生成和存储。
用于处理基因数据方法数据处理设备

[发明专利]一种压裂砂堵的预警方法、装置、存储介质及设备-CN201910900933.9有效
发明人：刘颜鹏 -专利权人：东软集团股份有限公司
申请日： 2019-09-23 - 公布日： 2022-05-10 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本申请实施例公开了一种压裂砂堵预警方法、装置、存储介质及设备，针对产生的压力时间序列，获取压力时间序列中的待处理时间序列片段。依次减小待处理时间序列片段的长度，获得每次减小后对应的第一待处理时间序列片段。计算待处理时间序列片段与每个第一待处理时间序列片段之间的相似度，并确定相似度满足预设条件的第一待处理时间序列片段。再根据相似度满足预设条件的第一待处理时间序列片段确定第三关键点，并根据第一关键点对应的时间点确定第三关键点对应的时间点。在第一关键点、第二关键点以及第三关键点对应的时间点对压力时间序列进行分割。当划分的时间序列片段中存在与预设时间序列片段相似的时间序列片段时，产生压裂砂堵预警。
一种压裂砂堵预警方法装置存储介质设备

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