本发明公开了一种外切型褐藻胶裂解酶VsAly7D及其重组菌株和应用。本发明所述外切型褐藻胶裂解酶的氨基酸序列如SEQ ID No.6所示,编码氨基酸序列的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。所述外切型褐藻胶裂解酶的适合反应温度为20‑35℃,在0‑30℃时具有高稳定性,因此该酶可在低温下有效降解底物,属于一种冷适应的褐藻胶裂解酶;所述外切型褐藻胶裂解酶对褐藻胶、polyG和polyM具有降解能力,降解方式为外切型,最终降解产物为不饱和单糖,并具有NaCl依赖性。本发明还构建了含所述外切型褐藻胶裂解酶VsAly7D编码基因的重组载体和重组菌体,能够为工业化应用和生产生物乙醇提供了良好的基础。