本发明涉及微生物的基因工程领域,具体的说是一种手霉素A和中尼霉素的生物合成基因簇。所述手霉素生物合成基因簇碱基序列如SEQ ID NO.1所示,其中手霉素生物合成基因簇为手霉素A和中尼霉素的生物合成基因簇,(1)负责手霉素A和中尼霉素生物合成的结构基因25个;(2)负责手霉素A和中尼霉素生物合成的调节基因3个;(3)负责手霉素A和中尼霉素生物合成的转运基因2个。通过对上述生物合成基因的遗传改造可以得到手霉素A和中尼霉素的结构类似物,本发明所提供的基因及其所编码的蛋白质,可以用来寻找和发现可用于医药、工业和农业的化合物、基因和蛋白。