本发明涉及小麦抗叶锈病基因Lr13的indel分子标记及其应用,所述indel分子标记位于小麦2B染色体第157755888位,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过对抗病和感病小麦进行遗传分析,通过构建遗传连锁图谱确定抗叶锈病基因Lr13的区间位置,并相应地开发了与该基因连锁的indel分子标记,该indel分子标记和小麦抗锈病基因Lr13高度连锁,通过该indel分子标记可以筛选出含有小麦抗叶锈病基因Lr13的小麦株系,提高选择效率加速小麦抗病育种的进程,实现多个抗病基因聚合育种的目标。
本发明公开了一种小麦抗叶锈病基因Lr42的SNP分子标记TC113325、利用该分子标记检测小麦抗叶锈病基因Lr42的方法及其应用,该分子标记通过以下引物扩增得到,其中上游引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示,下游引物序列如SEQ ID NO.3所示,利用上述SNP分子标记TC113325检测小麦抗叶锈病基因Lr42具有检测通量高、时间短、准确性高、易于实现自动化、成本低、环境友好等特点