本发明公开了一种菰黑粉菌分型鉴定方法及其应用,属于分子生物技术领域。本发明提供了一种用于菰黑粉菌分型鉴定的靶标,所述靶标来源于T型菰黑粉菌,核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明提供的一种菰黑粉菌分型鉴定方法,可定量检测复杂样品中T型菰黑粉菌,检测限低至0.0088ng/μL(22.36copies/μL),同时实现了对植物不同时期以及不同组织中T型菰黑粉菌的定量检测。
本发明涉及一种基于23S‑5S rRNA基因测序谱图分析法的铜绿假单胞菌分型鉴定方法,使用该方法不仅可以准确鉴定铜绿假单胞菌,还可以进行分子分型。基因序列设计特异性引物,应用FTA卡‑SYBR Green I荧光PCR直接扩增该片段,再将PCR产物简单稀释后进行测序反应,分析经毛细管电泳后比对测序谱图及数据,没有重叠峰的直接读取序列,以序列比对和详图分析结果获得鉴定及分型结果本发明提供的试剂和方法可对铜绿假单胞菌的23S‑5S rRNA基因进行正确测序,以序列比对和详图分析结果获得最终鉴定及分型结果,结合免费的公共基因数据库检索和7种亚型典型测序谱图,可准确地鉴定这种病原菌并进行分子分型