avrBs3/PthA家族基因相同,102bp重复单元在基因内重复数为19.5;无毒基因avrxa5编码1238个氨基酸,氨基酸的序列为SEQ ID NO.2,由102bp编码的34个氨基酸重复单元在该蛋白中重复本发明获得的avrxa5基因基因可作为水稻抗白叶枯病抗病育种的基因资源,将基因导入水稻白叶枯病菌PXO99A菌株后,可使含xa5抗病基因的水稻产生抗病性反应,使白叶枯病菌难以有效侵染水稻
本发明涉及一种水稻抗白叶枯病基因Xa4的分子标记及其应用。本发明的分子标记通过两条正向引物和一条公共反向引物PCR扩增得到,正向引物与公共反向引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑3所示。利用该水稻抗白叶枯病基因Xa4的分子标记,只需将提取的DNA样品通过简单的PCR即可完成对Xa4的基因分型,预测水稻白叶枯病抗性。
本发明公开了一种用于检测白叶枯病抗性基因Xa23的SNP分子标记,该SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述SNP分子标记多态性位于序列的第51位点处碱基为A/G。本发明中的分子标记结合KASP检测技术,无需凝胶电泳检测也不限制于高成本的限制性内酶,在Xa23遗传育种中可以高通量、快速、精确的鉴定Xa23基因的基因型,大大提高基因转育的效率,而且操作简单、成本低廉、周期短,标记的稳定性好,不受其它基因效应和环境因素的影响,可在早代选择,缩短育种年限,提高育种效率,适于推广应用,本发明对水稻抗白叶枯的品种改良具有重要意义,适用于Xa23基因的辅助选择育种。