本发明涉及一种芦笋茎枯病菌聚酮体合成酶及其编码基因和应用，属于生物技术领域。本发明提供了一种聚酮体合成酶，所述聚酮体合成酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示；研究表明，与野生型菌株XT3相比，聚酮体合成酶编码基因pks‑pa敲除菌株XT3‑KN的色素产量明显降低，并且，与聚酮体合成酶编码基因pks‑pa敲除菌株XT3‑KN相比，聚酮体合成酶编码基因pks‑pa导入菌株XT3‑KN‑RV产色素能力显著提高，说明氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示的聚酮体合成酶以及核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的编码聚酮体合成酶的基因在天门冬拟茎点霉的色素产生过程中起着重要作用。
