[发明专利]一种适用于微生物群体的宏基因组GutHi-C建库方法及应用有效
申请号: | 202310901421.0 | 申请日: | 2023-07-21 |
公开(公告)号: | CN116606910B | 公开(公告)日: | 2023-10-13 |
发明(设计)人: | 孔思远;张玉波;李晨莹;卢宇曦;杨金宝;潘玮华 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C40B50/06 |
代理公司: | 北京中普鸿儒知识产权代理有限公司 11822 | 代理人: | 曲芳兵 |
地址: | 518000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种适用于微生物群体的宏基因组GutHi‑C建库方法,包括如下步骤:1)微生物分离提纯:微生物样本洗涤,添加培养基并自然沉降,4000g离心力对微生物分离;2)微生物进行裂解及甲醛交联;3)对步骤2)中产物进行酶切,然后用混有生物素标记的碱基对酶切后黏性末端进行补平,并将互作DNA邻近连接;4)将步骤3)中获得产物纯化后,加入环状共沉淀DNA,互作DNA超声片段化;5)基于生物素富集邻近互作片段,在免疫磁珠上进行末端修复与加A并与接头连接;6)进行文库预扩增QC质量控制检验,再进行正式扩增即得到GutHi‑C文库。本发明构建的GutHi‑C文库在高通量测序时,各方面数据均优于现有技术,说明本申请的建库方法更有优势。 | ||
搜索关键词: | 一种 适用于 微生物 群体 宏基 guthi 方法 应用 | ||
【主权项】:
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