[发明专利]一种大规模单细胞测序数据的细胞异质性分析方法、装置和计算机可读存储介质在审

专利信息
申请号: 202310784889.6 申请日: 2023-06-29
公开(公告)号: CN116933072A 公开(公告)日: 2023-10-24
发明(设计)人: 姜昊;汪蒙洁 申请(专利权)人: 中国人民大学
主分类号: G06F18/214 分类号: G06F18/214;G06F18/24;G06F18/23;G06N3/0464;G06N3/08;G16B20/20
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 100872 *** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 暂无信息 说明书: 暂无信息
摘要: 发明公开了一种大规模单细胞测序数据的细胞异质性分析方法、装置和计算机可读存储介质。本发明将核非负矩阵分解与深度神经网络相结合,构造了一种称为KNMF‑DNN的聚类方法。本发明的方法从总体数据中选择一些具有代表性的子集,使用核非负矩阵分解方法对其进行聚类;然后将代表子集作为训练集,剩余数据作为测试集,利用聚类得到的标签,通过深度神经网络对剩余数据进行分类,从而实现整个数据的聚类。此外,本发明还使用分层抽样的思想来选择最具代表性的样本,聚类样本和分类样本的最佳划分由KL散度决定。实验结果表明,与其他最新方法相比,KNMF‑DNN在三个真实scRNA测序数据集上的结果更优异。
搜索关键词: 一种 大规模 单细胞 序数 细胞 异质性 分析 方法 装置 计算机 可读 存储 介质
【主权项】:
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