[发明专利]一种结合参考库先验知识的宏基因组学分箱方法及系统在审
| 申请号： | 202210335489.2 | 申请日： | 2022-03-31 |
| 公开（公告）号： | CN114664383A | 公开（公告）日： | 2022-06-24 |
| 发明（设计）人： | 宋闻欢 | 申请（专利权）人： | 威海新元果业技术服务有限公司 |
| 主分类号： | G16B40/30 | 分类号： | G16B40/30;G16B20/40;G16B30/00 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 闫伟姣 |
| 地址： | 264204 山东省*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明涉及宏基因组学和数据科学技术领域，提供了一种结合参考库先验知识的宏基因组学分箱方法及系统，所述方法包括：获取目标序列数据集，对其中的每个序列样本进行特征提取，经特征变换后得到分箱特征向量集；将所述目标序列数据集与参考库进行对比，得到物种数量估算值和各序列样本属于不同物种的置信度，进而得到分箱数量可行区间和各物种的置信聚类中心，并以此作为先验知识；对所述分箱数量可行区间的每个可行分箱数量，采用聚类方法对分箱特征向量集进行聚类，选取最优聚类结果，由最优聚类结果实现对目标序列数据集的分箱。与现有技术相比，本发明解决了现有宏基因组分箱不能处理未知物种序列或分箱精度不足等问题。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 结合 参考 先验 知识 宏基 学分 方法 系统 | ||
【主权项】：
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