[发明专利]一种环境样本中抗生素抗性基因的高通量检测方法和系统在审
| 申请号： | 202111282530.6 | 申请日： | 2021-11-01 |
| 公开（公告）号： | CN113943787A | 公开（公告）日： | 2022-01-18 |
| 发明（设计）人： | 韩毛振;张雁;汪栋;罗学才 | 申请（专利权）人： | 安徽医科大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;G16B30/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 | 代理人： | 刘杰 |
| 地址： | 230032*** | 国省代码： | 安徽;34 |
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| 摘要： | 本发明实施例公开了一种环境样本中抗生素抗性基因的高通量检测方法和系统，对环境样本的宏基因组DNA进行提取和测序建库，获得宏基因组数据；对所述宏基因组数据进行质量控制，后进行拼接，获得拼接序列；将所述拼接序列进行基因预测和蛋白质翻译，获取具有完整序列的基因；对具有完整序列的所述基因进行抗生素抗性基因的预测和筛选，获得第一抗生素抗性基因，并对其来源进行预测，并提取出未检测到来源的第二抗生素抗性基因的序列并对其蛋白质序列进行提取和来源检测；对所述来源信息进行分类地位解析，获得所述环境样本中抗生素抗性基因的组成。该方法能实现对环境样本抗生素抗性基因的全面检测和分析，从而对环境样本进行有效的检测。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 环境 样本 抗生素 抗性 基因 通量 检测 方法 系统 | ||
【主权项】：
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