[发明专利]一种分析松材线虫种群遗传多样性的方法在审
| 申请号： | 202110414199.2 | 申请日： | 2021-04-16 |
| 公开（公告）号： | CN113096741A | 公开（公告）日： | 2021-07-09 |
| 发明（设计）人： | 丁晓磊;叶建仁;林司曦;黄金思;奚晓桐;汪青桐 | 申请（专利权）人： | 南京林业大学 |
| 主分类号： | G16B40/30 | 分类号： | G16B40/30;G16B20/20;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 11616 | 代理人： | 李灿 |
| 地址： | 210000 江苏省南*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种分析松材线虫种群遗传多样性的方法，先收集来自于不同地理位置的松材线虫虫株，提取其DNA并进行高通量测序；利用自主参与编写的生物信息学软件分析全基因组信息，得到各种SNPs数据及基因型类型，获知松材线虫体内SNPs位点分布情况，进行聚类分析，筛选获得特异性SNP位点。本申请通过聚类分析可将这各虫株分为三类：其中四川省虫株单独聚为A类，广东省有两株虫株分为B类，其余6株虫株分为C类。并且焦磷酸测序结果显示GD位点可将C类虫株与其他两类分开。广东省和四川省松材线虫遗传多样性较高；为推测松材线虫病的传播途径提供了理论基础。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 分析 松材线虫 种群 遗传 多样性 方法 | ||
【主权项】：
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