[发明专利]集体细胞突变数据和蛋白质网络的肿瘤驱动通路预测系统有效
申请号: | 202110383651.3 | 申请日: | 2021-04-09 |
公开(公告)号: | CN113113083B | 公开(公告)日: | 2022-08-09 |
发明(设计)人: | 吴昊;陈中立;董记华 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B40/00 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 李圣梅 |
地址: | 250101 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本公开提出了集体细胞突变数据和蛋白质网络的肿瘤驱动通路预测系统,包括:加权无向网络图构建模块,被配置为:利用顶点加权和边缘加权方法构建加权无向网络图;加权有向网络图构建模块,被配置为:利用热扩散原理在上执行重启随机游走以构建加权有向图;初始候选模块集构建模块,被配置为:利用有向网络图的强连接性原理创建具有一定基因数量的初始候选模块集;最优驱动模块集构建模块,被配置为:对初始候选模块集中的大型模块利用导出子图方式进行拆分,并对小型模块利用贪心策略进行扩展,得到最优驱动模块集。构建的生物网络不仅集成了基因间的生物相关性,而且还反映了基因间的拓扑相关性。将复杂网络拓扑结构特征运用到生物网络中。 | ||
搜索关键词: | 集体 细胞 突变 数据 蛋白质 网络 肿瘤 驱动 通路 预测 系统 | ||
【主权项】:
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