[发明专利]基于链式搜索算法的母系MT单倍群鉴定方法、装置及设备在审
| 申请号： | 202110024674.5 | 申请日： | 2021-01-08 |
| 公开（公告）号： | CN112687335A | 公开（公告）日： | 2021-04-20 |
| 发明（设计）人： | 马玉昆;黎松;贾寒;李峰峰;温颜华;李根;吕丽 | 申请（专利权）人： | 北京果壳生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B20/20;G16B50/00 |
| 代理公司： | 北京细软智谷知识产权代理有限责任公司 11471 | 代理人： | 付登云 |
| 地址： | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于链式搜索算法的母系MT单倍群鉴定方法、装置及设备，属于线粒体单倍群鉴定技术领域，通过将目标数据库的母系单倍群数据解析为易读且易处理的txt格式；将样本ASA芯片检测结果转换成forward链、计算检出率和性别；提取每个样本检测结果的突变位点信息，并根据突变位点信息及命名规则，对基因型信息进行命名并进行格式转换，获取目标格式的基因型信息；计算每个样本的所有检测到MT单倍群的初始得分；统计单个样本利用全局链式搜索法给所有候选MT单倍群的最终得分；将全局链式搜索法鉴定的单倍群与Haplogrep2软件进行比较评估方法的鲁棒性。本发明能对被检样本不同IlluminaSNP芯片数据进行母系MT单倍群鉴定，成本低、准确性高、操作方便、适用广。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 链式 搜索 算法 母系 mt 单倍群 鉴定 方法 装置 设备 | ||
【主权项】：
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