[发明专利]一种基于单核苷酸分子对接的核酸适配体设计方法有效
| 申请号： | 202010924315.0 | 申请日： | 2020-09-04 |
| 公开（公告）号： | CN112210587B | 公开（公告）日： | 2021-04-30 |
| 发明（设计）人： | 黄强;宋梦华;刘建平;颜志超;李园园 | 申请（专利权）人： | 复旦大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6811 | 分类号： | C12Q1/6811;C12N15/115 |
| 代理公司： | 上海正旦专利代理有限公司 31200 | 代理人： | 陆飞;陆尤 |
| 地址： | 200433 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明属于核酸适配体设计技术领域，具体为一种基于单核苷酸分子对接的核酸适配体设计方法。本发明从靶标小分子的实验结构出发，通过水合对接获得结合在靶标小分子周围的核苷酸位置；随后将离散的核苷酸组装为完整的核酸适配体；最后采用MST实验检测所设计核酸适配体与靶标小分子的结合能力。本发明已用于毒素小分子冈田酸(OA)的核酸适配体设计中；该毒素是一种分布广泛的海洋生物毒素，会导致腹泻型贝类中毒，因此检测海产品中的OA对于食品安全具有重要意义。通过计算方法设计得到靶向OA的核酸适配体OA‑D1，MST实验验证该核酸适配体与OA的平衡解离常数为75.6 nM；说明该计算设计方法是合理且有效的。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 核苷酸 分子 对接 核酸 适配体 设计 方法 | ||
【主权项】：
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