[发明专利]基于高通量测序技术检测玉米叶部病原真菌的方法及应用在审
申请号: | 202010791245.6 | 申请日: | 2020-08-07 |
公开(公告)号: | CN111808936A | 公开(公告)日: | 2020-10-23 |
发明(设计)人: | 刘文德;田雪亮;李智强 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/6895;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 赵徐平 |
地址: | 100193 北京市海淀区圆*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了基于高通量测序技术检测玉米叶部病原真菌的方法及应用,属于玉米叶部病原真菌检测技术领域。具体方法如下:(1)取玉米植株叶片,富集叶部微生物,提取微生物总DNA;(2)PCR扩增真菌ITS序列,高通量测序;(3)将高通量测序结果根据97%阈值划分OTU,进行物种鉴定,统计玉米叶部病原真菌的种类和序列数量;(4)以每一属病原真菌序列在总序列中的比例作为属水平上的丰度,将丰度大于0.5%的列为高丰度病原真菌,小于0.5%的列为低丰度病原真菌;(5)病原真菌丰度与病害病情指数呈正相关,根据病原真菌丰度预测后期病害发生种类和程度。本发明方法检测准确,效率高,在玉米叶部病害防治中具有重要价值。 | ||
搜索关键词: | 基于 通量 技术 检测 玉米 病原 真菌 方法 应用 | ||
【主权项】:
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