[发明专利]一种基于蛋白环境描述小分子片段属性的指纹设计方法有效

专利信息
申请号: 202010150513.6 申请日: 2020-03-06
公开(公告)号: CN111326218B 公开(公告)日: 2022-08-05
发明(设计)人: 季长鸽;单金文;张增辉 申请(专利权)人: 华东师范大学
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50
代理公司: 上海蓝迪专利商标事务所(普通合伙) 31215 代理人: 徐筱梅;张翔
地址: 200241 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于蛋白环境描述小分子片段属性的指纹设计方法,其特点是该方法通过识别蛋白的口袋表层氨基酸原子,计算蛋白口袋原子和对接后的小分子的相互作用关系,及其对应的蛋白原子和小分子原子,设计两种不同描述小分子片段属性的指纹,一种是分别定义蛋白属性指纹和小分子属性指纹一一对应,通过寻找相似蛋白属性指纹找到相似的小分子属性指纹,另一种是根据蛋白环境设计描述整个分子的指纹,通过计算两组指纹的相似性判断两个小分子片段的相似性。本发明与现有技术相比具有快速生成两种指纹,将其应用于实际药物分子的设计和修改过程中,能够快速找到多个相似片段,生成多个新分子,有效的帮助药物化学家快速进行药物分子设计与修改。
搜索关键词: 一种 基于 蛋白 环境 描述 分子 片段 属性 指纹 设计 方法
【主权项】:
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