[发明专利]采用双随机游走预测疾病相关代谢物的方法在审

专利信息
申请号: 201910854180.2 申请日: 2019-09-10
公开(公告)号: CN110610765A 公开(公告)日: 2019-12-24
发明(设计)人: 雷秀娟;帖娇娇;赵杰 申请(专利权)人: 陕西师范大学
主分类号: G16H50/50 分类号: G16H50/50;G16H50/70;G16H70/00
代理公司: 61200 西安通大专利代理有限责任公司 代理人: 朱海临
地址: 710119 陕西*** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明公开了一种采用双随机游走预测疾病相关代谢物的方法,首先利用疾病的语义信息计算疾病的语义相似性,根据疾病和代谢物的关系计算代谢物的功能相似性;其次根据已知的代谢物‑疾病之间的关系分别计算疾病和代谢物的高斯核作用谱相似性;再次将疾病语义相似性和疾病的高斯核作用谱相似性构建为最终的疾病相似性网络,将代谢物功能相似性和代谢物的高斯作用谱相似性构建为最终的代谢物相似性网络;最后,将疾病相似性、代谢物相似性和已知的代谢物‑疾病关系网络构建为一个二部异构网络,在这个异构网中利用双随机游走方法预测疾病相关的代谢物。经过试验验证,本发明方法能够有预测疾病相关的代谢物,为生物实验提供依据,并且提高疾病的诊断和治疗水平。
搜索关键词: 代谢物 疾病 功能相似性 语义相似性 随机游走 高斯核 构建 预测 诊断和治疗 关系计算 疾病关系 生物实验 网络构建 异构网络 语义信息 高斯 异构 网络 验证 试验
【主权项】:
1.一种采用双随机游走预测疾病相关代谢物的方法,其特征在于,包括以下步骤:/n(1)将已知的疾病代谢物关系转化为邻接矩阵/n定义X={m
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