[发明专利]一种寻找胚胎干细胞向原始生殖细胞分化过程中Wnt信号通路的靶基因的方法在审

专利信息
申请号: 201910593462.1 申请日: 2019-07-03
公开(公告)号: CN110272919A 公开(公告)日: 2019-09-24
发明(设计)人: 李碧春;张晨;左其生;王曼;金晶;李婷婷;张亚妮;孙红艳 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12N15/867 分类号: C12N15/867;C12N15/66;C12N5/10;C12Q1/686
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 马云华
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种寻找胚胎干细胞向原始生殖细胞分化过程中Wnt信号通路的靶基因的方法,涉及生物技术领域,本发明所述方法首先对Wnt信号通路的关键转录因子TCF7L2进行靶基因预测,对预测靶基因进行GO功能注释,筛选出其中共同参与生殖细胞发育及干细胞分化的保守性靶基因作为待选靶基因;通过体内外试验验证Wnt信号对待选靶基因转录水平的调控作用,检测待选靶基因的启动子中所述转录因子结合位点缺失时、Wnt信号对待选靶基因转录水平是否有调节作用,通过ChIP‑qPCR验证β‑Catenin/转录因子复合物与待选靶基因的结合作用,从而确定待选靶基因是否对Wnt信号具有靶向响应作用。本发明所述方法简单易行。
搜索关键词: 靶基因 原始生殖细胞 胚胎干细胞 分化过程 转录水平 生殖细胞 转录因子结合位点 转录因子复合物 验证 生物技术领域 靶基因预测 干细胞分化 调控作用 功能注释 转录因子 保守性 启动子 靶向 筛选 体内 发育 检测 试验 响应 预测
【主权项】:
1.一种寻找胚胎干细胞向原始生殖细胞分化过程中Wnt信号通路的靶基因的方法,包括以下步骤:(1)采用预测软件对Wnt信号通路的某一转录因子的结合靶基因预测,对预测的靶基因进行GO功能注释,根据注释选取生殖细胞发育和干细胞发育过程中共同的靶基因,得到待选靶基因;(2)对待选靶基因进行体内和体外实验验证Wnt信号通路对待选靶基因转录水平是否有调节作用;(3)检测待选靶基因的启动子中所述转录因子结合位点缺失时、Wnt信号对待选靶基因转录水平是否有调节作用;(4)通过ChIP‑qPCR验证β‑Catenin/转录因子复合物与待选靶基因的结合作用;(5)若待选靶基因经过步骤(2)~(4)的检测的结果为:Wnt信号通路对待选靶基因转录水平有调节作用、待选靶基因的启动子中所述转录因子结合位点缺失时的Wnt信号通路对待选靶基因转录水平无调节作用并且β‑Catenin/转录因子复合物能够通过结合待选靶基因启动子区域调节其转录,则判断该待选靶基因为Wnt信号通路的直接靶基因;所述步骤(2)~(4)之间无时间顺序上的限定。
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