[发明专利]一种用于肝癌患者预后风险评估的基因检测试剂盒及应用有效
| 申请号： | 201810448563.5 | 申请日： | 2018-05-11 |
| 公开（公告）号： | CN108611419B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 刘小龙;刘景丰;李振丽;柯坤;蔡志雄;陈耕 | 申请（专利权）人： | 福建医科大学孟超肝胆医院（福州市传染病医院） |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司： | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人： | 冷红梅 |
| 地址： | 350000 *** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种用于肝癌分群和预后风险评估的基因检测试剂盒、数学模型，及其在肝癌分群和预后风险评估中的应用。本发明基于二代测序技术与TCGA(The Cancer Genome Atlas,肿瘤基因组图谱)数据库建立用于肝癌分群及肝癌预后风险评估模型，发现肝癌具有两个明显差异的预后亚群及用于肝癌预后评估的基因群。本发明发现由CA9,CXCL5,G6PD,MMP12,MYBL2和SLC1A5组成的6基因的模型，定义为预后指数PI＝exp(p')/exp(1+p')，其中p'＝zCA9*1.64+zCXCL5*1.22+zMMP12*1.52+1.93*zMYBL2+0.76*zSLC1A5+2.43*zG6PD‑3.86，该模型可以区分判断不同肝癌预后亚群，反映肝癌患者预后风险。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 肝癌 患者 预后 风险 评估 基因 检测 试剂盒 应用 | ||
【主权项】：
1.一种用于肝癌患者预后风险评估的基因检测试剂盒，主要包括特异性PCR扩增引物和PCR反应试剂，其特征在于：所述特异性PCR扩增引物序列如下：CA9引物：上游引物：5'‑GCACAGAAGGGGAACCAA‑3'；下游引物：5'‑CTCTGGCTGGCTTCTCACAT‑3'；CXCL5引物：上游引物：5'‑AGACCACGCAAGGAGTTCATC‑3'；下游引物：5'‑TCCTTGTTTCCACCGTCCAAAA‑3'；G6PD引物：上游引物：5'‑TGCCCCCGACCGTCTAC‑3'；下游引物：5'‑ATGCGGTTCCAGCCTATCTG‑3'；MMP12引物：上游引物：5'‑GATGTGGAGTCCCCGATGTC‑3'；下游引物：5'‑CACGGGCAAAAACCACCAAA‑3'；MYBL2引物：上游引物：5'‑TGCCAGGGAGGACAGACAAT‑3'；下游引物：5'‑CTGTACCGATGGGCTCCTGTT‑3'；SLC1A5引物：上游引物：5'‑TCATGTGGTACGCCCCTGT‑3'；下游引物：5'‑GCGGGCAAAGAGTAAACCCA‑3'。
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