[发明专利]一种山楂EST-SSR标记引物的制备方法及应用有效
| 申请号： | 201810344913.3 | 申请日： | 2018-04-17 |
| 公开（公告）号： | CN108330207B | 公开（公告）日： | 2021-09-14 |
| 发明（设计）人： | 赵玉辉;刘诗佳;郭印山;刘丽婷 | 申请（专利权）人： | 沈阳农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6811;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京久维律师事务所 11582 | 代理人： | 邢江峰 |
| 地址： | 110000 辽宁省沈*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明公开了一种山楂EST‑SSR标记引物的制备方法，包括以下步骤：1)从山楂转录组数据中筛选组装长度大于5000bp的片段序列；2)使用SSRHunter软件对每条片段进行SSR发掘，单一序列中挑出占富含二、三、四或五核苷酸重复且长度≥10bp的EST序列；3)使用primer3软件对SSR上游和下游各150bp的碱基序列进行EST‑SSR引物的筛选，即得山楂EST‑SSR标记引物。本发明提出山楂EST‑SSR标记引物的制备方法及应用，为今后山楂的相关研究提供参考，促进和提高山楂的基础研究水平。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 山楂 est ssr 标记 引物 制备 方法 应用 | ||
【主权项】：
1.一种山楂EST‑SSR标记引物的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：1)从山楂转录组数据中筛选组装长度大于5000bp的片段序列；2)使用SSRHunter软件对每条片段进行SSR发掘，单一序列中挑出占富含二、三、四或五核苷酸重复且长度≥10bp的EST序列；3)使用primer3软件对SSR上游和下游各150bp的碱基序列进行EST‑SSR引物的筛选，即得山楂EST‑SSR标记引物。
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