[发明专利]一种疾病关联基因组合的统计方法及系统在审

专利信息
申请号: 201810134414.1 申请日: 2018-02-09
公开(公告)号: CN108256293A 公开(公告)日: 2018-07-06
发明(设计)人: 赵毅;张阳 申请(专利权)人: 哈尔滨工业大学深圳研究生院
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18;G06F19/24;G16H50/30
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 王戈
地址: 518000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开一种疾病关联基因组合的统计方法及系统。该统计方法包括:采用全基因组关联分析方法计算基因序列中的每个单核苷酸多态性位点的显著性,显著性表示单核苷酸多态性位点与疾病的关联程度,获得单核苷酸多态性位点显著性;根据核苷酸显著性和阈值,筛选出与疾病关联的单核苷酸多态性位点,获得关联单核苷酸多态性位点;采用基于极端梯度的Boosting的集成学习算法对关联单核苷酸多态性位点对应的人分为患病和不患病两类,获得关联基因组合。本发明通过全基因组关联分析方法与基于梯度的Boosting的集成学习算法相结合的方法对关联单核苷酸多态性位点对应的人分为患病和不患病两类,获得关联基因组合,提高了疾病关联基因组合获取结果的准确性。
搜索关键词: 单核苷酸多态性位点 关联 基因组合 显著性 疾病 集成学习算法 关联分析 全基因组 统计 计算基因 核苷酸 筛选
【主权项】:
1.一种疾病关联基因组合的统计方法,其特征在于,所述统计方法包括:采用全基因组关联分析方法计算基因序列中的每个单核苷酸多态性位点的显著性,获得单核苷酸多态性位点显著性,所述显著性表示单核苷酸多态性位点与疾病的关联程度;根据所述核苷酸显著性和阈值,筛选出与疾病关联的单核苷酸多态性位点,获得关联单核苷酸多态性位点;采用基于极端梯度的Boosting的集成学习算法对所述关联单核苷酸多态性位点对应的人分为患病和不患病两类,获得关联基因组合。
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