[发明专利]标签及其制备方法和应用有效
| 申请号： | 201810010426.3 | 申请日： | 2018-01-05 |
| 公开（公告）号： | CN108165620B | 公开（公告）日： | 2019-05-14 |
| 发明（设计）人： | 糜庆丰;朱鹏远;吴春求;黄铨飞;潘兆东;王杨;周幸芝;刘丽菲 | 申请（专利权）人： | 东莞博奥木华基因科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12N15/10;C12N15/11;C40B50/06;C12Q1/6883;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人： | 巩克栋 |
| 地址： | 523808 广东省东莞市松山湖高新技*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了制备标签的方法，标签，标签接头及基于DNA标签文库的基因测序方法。本发明提供的标签制备方法可以快速获得标签序列，标签筛选试验周期短；基于该方法获得的384个标签及标签接头可应用于DNA标签文库构建及基因测序，从而实现384个样品的并行测序，稳定性好，标签识别率高，准确性高，尤其适用于Ion torrent平台。 | ||
| 搜索关键词： | 标签 基因测序 制备方法和应用 标签识别 标签序列 标签制备 筛选试验 测序 构建 制备 并行 应用 | ||
【主权项】：
1.制备标签的方法，包括以下步骤：(1)生成长度阈值范围8～10bp内的所有核苷酸序列，构成候选标签池；(2)对候选标签池内的核苷酸序列进行筛选，筛选标准如下：去除3’末端不为C的核苷酸序列；去除5’首端为C的核苷酸序列；去除包含AGC、GCC、AAG、CTGC、CCG、CAA、AAA、TTT、CCC、GGG的核苷酸序列；去除5’端是AGG起始的核苷酸序列；去除3’端是CC终止的核苷酸序列；(3)对筛选后的候选标签池内的核苷酸序列进行两两序列比对，去除差异位置小于2的任一序列；(4)将候选标签池内的核苷酸序列插入标签接头3’末端“GAT”的上游，去除使标签接头出现二聚体和发夹结构的核苷酸序列；(5)任选候选标签池内的核苷酸序列进行试验筛选，筛选测序数据量占平均数据量的比例大于25％比例阈值的核苷酸序列，作为标签。
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