[发明专利]基于信息论基因转录本组装与量化方法及系统有效
| 申请号： | 201711377630.0 | 申请日： | 2017-12-19 |
| 公开（公告）号： | CN107944226B | 公开（公告）日： | 2020-03-27 |
| 发明（设计）人： | 索津莉;鲍峰;戴琼海 | 申请（专利权）人： | 清华大学 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 张润 |
| 地址： | 10008*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提出了一种基于信息论基因转录本组装与量化方法及系统，其中，方法包括：将测序的读段与参照的基因组对齐，并根据测序的读段与参照的基因组对齐结果对初始的基因与转录本的开始位置与终止位置进行预测；在预测完之后，建立有向图以模拟可能的转录本，得到候选转录本集合；根据最大化信息传输容量的方式对候选转录本集合进行转录本预测与峰度估计。该发明具有能够不依赖于外部的基因位置标记，基因组装准确性显著提高，提升测序精度的优点。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 信息论 基因 转录 组装 量化 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种基于信息论基因转录本组装与量化方法，其特征在于，包括以下步骤：将测序的读段与参照的基因组对齐，并根据测序的读段与参照的基因组对齐结果对初始的基因与转录本的开始位置与终止位置进行预测；在预测完之后，建立有向图以模拟可能的转录本，得到候选转录本集合；根据最大化信息传输容量的方式对候选转录本集合进行转录本预测与峰度估计。
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