[发明专利]一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组在审
| 申请号： | 201711216625.1 | 申请日： | 2017-11-28 |
| 公开（公告）号： | CN109837341A | 公开（公告）日： | 2019-06-04 |
| 发明（设计）人： | 裘敏燕 | 申请（专利权）人： | 上海联吉医学检验所有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 200331 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及分子生物学基因技术领域和医学领域，具体公开了一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组。本发明对MGMT基因启动子CpG岛甲基化程度进行分析，设计相应的引物组，对样本基因组DNA进行甲基化特异性PCR(MSP)扩增后，以Ion Torrent半导体芯片测序技术进行检测。本发明的检测方法具有通量大，特异性及灵敏度高，结果稳定，重复性好，检测速度快的优点。为MGMT基因启动子甲基化的检测、测试、分析和评估提供了一条快速、可靠、准确的新途径，从而为筛选敏感个体的个性化用药提供理论基础。 | ||
| 搜索关键词： | 甲基化 检测 启动子 引物组 甲基化特异性PCR 启动子CpG岛 分子生物学 半导体芯片 分析和评估 样本基因组 测序技术 基因技术 理论基础 医学领域 灵敏度 新途径 扩增 通量 个性化 筛选 测试 敏感 分析 | ||
【主权项】：
1.一种MGMT基因启动子甲基化的检测方法及其引物组，具体步骤为：利用生物信息学知识和相关生物信息学软件，对公开数据库中所能检索到的MGMT基因启动子CpG岛序列信息，用Primer Premier 5.0软件设计PCR引物；采用甲基化特异性PCR(MSP)方法对待检测样本基因组DNA进行C‑T转化及PCR扩增；将PCR扩增产物进行扩增子文库的构建，ISP（Ion Sphere™ Particles, Ion微球）模板的制备，在Ion Torrent PGM系统上进行测序，并用软件对相关测序序列进行分析。
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