[发明专利]宏基因组的基因分析方法、装置、设备及存储介质有效
申请号: | 201710838808.0 | 申请日: | 2017-09-18 |
公开(公告)号: | CN107832584B | 公开(公告)日: | 2021-06-22 |
发明(设计)人: | 郭宁;魏彦杰;张慧玲;葛健秋;滕彦宁 | 申请(专利权)人: | 中国科学院深圳先进技术研究院 |
主分类号: | G16B15/20 | 分类号: | G16B15/20;G06N20/00 |
代理公司: | 深圳智趣知识产权代理事务所(普通合伙) 44486 | 代理人: | 王策 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明适用计算机科学与生物信息学交叉的技术领域,提供了一种宏基因组的基因分析方法、装置、设备以及存储介质,该方法包括:对接收的每组测序数据进行筛选和组装,生成测序数据对应的组装数据,通过对组装数据进行基因预测,生成每组测序数据的预测基因,根据预测基因构建基因字典,根据基因字典中每条基因的丰度对基因字典进行聚类,根据聚类后的基因簇对筛选后的每组测序数据进行分类和组装,生成并输出宏基因组的基因,从而在没有现有生物基因作为参考基因组的情形下,实现宏基因组的基因分析,避免了参考基因组带来的局限性,并有效地提高了宏基因组基因分析的准确度。 | ||
搜索关键词: | 宏基 基因 分析 方法 装置 设备 存储 介质 | ||
【主权项】:
一种宏基因组的基因分析方法,其特征在于,所述方法包括下述步骤:接收用户输入的宏基因组的测序数据,对所述每组测序数据进行筛选和组装,生成所述每组测序数据对应的组装数据;通过对所述每组组装数据进行基因预测,生成所述每组测序数据的预测基因,根据所述预测基因构建所述宏基因组的基因字典;统计所述基因字典中每条基因相对于所述筛选后的所有测序数据的丰度,根据所述每条基因的丰度对所述基因字典中的基因进行聚类,获得聚类后的基因簇;根据所述基因簇对所述筛选后的每组测序数据进行分类和组装,生成并输出所述宏基因组的基因。
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