[发明专利]一种肿瘤个体化临床实验文本挖掘的方法和系统有效
申请号: | 201710724224.0 | 申请日: | 2017-08-22 |
公开(公告)号: | CN107633153B | 公开(公告)日: | 2021-05-28 |
发明(设计)人: | 安娜;朱师达;王慧;邵利彬;于竞 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | G16H50/70 | 分类号: | G16H50/70;G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 彭家恩;罗瑶 |
地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本申请公开了一种肿瘤个体化临床实验文本挖掘的方法和系统。本申请的肿瘤个体化临床实验文本挖掘方法包括,(1)根据待测对象个体化信息数据在预设的临床实验数据库中进行查询,筛选与个体化信息数据相匹配的临床实验文本;筛选获取优先等级为,疾病类型>性别>年龄>国家>生物标记物变异信息;(2)对步骤(1)筛选获取的实验文本进行排序,基因变异位点完全匹配>基因的其它变异匹配>基因匹配>相关基因匹配;(3)输出排序实验文本,即个体化临床实验文本。本申请的方法,不仅能为广大患者和医生提供更多、更精准的个体化治疗方案;而且,可以获得更全面、准确、有效的参考数据,提高了个体化治疗方案的准确度和效率,节约时间成本。 | ||
搜索关键词: | 一种 肿瘤 个体化 临床实验 文本 挖掘 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种肿瘤个体化临床实验文本挖掘的方法,其特征在于:包括以下步骤,(1)根据待测对象的个体化信息数据在预设的临床实验数据库中进行查询,筛选与所述个体化信息数据相匹配的临床实验文本;所述个体化信息数据包括待测对象的性别、年龄、国家、疾病类型和生物标记物变异信息;所述临床实验数据库中包含若干个临床实验文本,每个临床实验文本至少包含研究识别号、临床期、招募状态信息、研究终止时间、标题、疾病类型、干预措施、招募人数信息、招募者信息、结果检测标准和受试者信息等临床实验数据;所述受试者信息至少包括受试者的性别、年龄和国家;所述生物标记物变异信息包括单基因多态性、单核苷酸变异、插入缺失变异、拷贝数变异、基因融合、表达量变异;临床实验文本筛选获取的优先等级依序为,疾病类型>性别>年龄>国家>生物标记物变异信息;其中,生物标记物变异信息按照匹配的层次优先等级依序分为,基因变异位点完全匹配>基因的其它变异匹配>基因匹配>相关基因匹配;(2)对步骤(1)筛选获取的临床实验文本进行排序,排序的优先顺序为,基因变异位点完全匹配>基因的其它变异匹配>基因匹配>相关基因匹配,每个等级按分数由高到低排序;其中,基因变异位点完全匹配按照变异位点匹配个数进行打分,变异位点匹配个数越多分数越高;基因的其它变异匹配、基因匹配和相关基因匹配,按匹配程度进行打分,匹配程度越高分数越高;(3)按照步骤(2)的排序输出临床实验文本的表格信息,获得待测对象的个体化临床实验文本;所述表格信息包括,临床实验文本的研究识别号、临床期、招募状态信息、研究终止时间、标题、疾病类型、干预措施、招募人数信息、招募者信息和结果检测标准;步骤(1)和步骤(3)中,干预措施包括治疗采用的靶向药物、化疗药物、疫苗、激素或其它已研究的生物制剂产品,或其它非侵入性方法;招募者信息包括招募的研究单位及其地理位置信息和联系方式;步骤(1)和步骤(2)中,所述相关基因包括基因家族的基因、相关通路的基因和蛋白相互作用位点的基因。
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