[发明专利]计算基因型对表型额外贡献的方法及装置有效
申请号: | 201710669992.0 | 申请日: | 2017-08-07 |
公开(公告)号: | CN107315922B | 公开(公告)日: | 2020-06-23 |
发明(设计)人: | 朱天生;范嘉庚;刘艳波 | 申请(专利权)人: | 杭州祥音医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 周文波 |
地址: | 311200 浙江省杭州市萧山*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供了计算基因型对表型额外贡献的方法及装置,涉及生物信息学技术领域,其中,该计算基因型对表型额外贡献的方法包括:首先,通过权威文献及生物数据库获取基因多态性位点信息,其中,基因多态性位点信息包括表型、基因型、基因频率和OR值,之后,按照基因多态性位点信息对应的表型将物种细分为多个亚类,接着,根据基因频率和OR值计算每种亚类中各个基因型的平均贡献值,然后,对单个待测试物种进行基因多态性位点检测,获取待测试物种的特定基因型,最后,根据OR值和平均贡献值计算特定基因型的对表型额外贡献值,通过上述方法能够方便快捷的计算出基因型对表型的额外贡献。 | ||
搜索关键词: | 计算 基因型 表型 额外 贡献 方法 装置 | ||
【主权项】:
计算基因型对表型额外贡献的方法,其特征在于,包括:通过权威文献及生物数据库获取基因多态性位点信息,其中,所述基因多态性位点信息包括表型、基因型、基因频率和OR值;按照所述基因多态性位点信息对应的表型将物种细分为多个亚类;根据所述基因频率和所述OR值计算每种所述亚类中各个所述基因型的平均贡献值;对单个待测试物种进行基因多态性位点检测,获取所述待测试物种的特定基因型;根据所述OR值和所述平均贡献值计算所述特定基因型的对表型额外贡献值。
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