[发明专利]一种诺如病毒溯源方法及其引物、试剂盒、应用有效
申请号: | 201710113551.2 | 申请日: | 2017-02-28 |
公开(公告)号: | CN106987655B | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 杨向莹;张捷;张文玲;李小林;王琳;畅晓晖;万晓楠;陈广全 | 申请(专利权)人: | 北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 | 代理人: | 李敏 |
地址: | 100026*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种诺如病毒溯源方法及其引物、试剂盒、应用,包括如下步骤:(1)富集诺如病毒并提取所述诺如病毒的基因组RNA,反转录为cDNA,备用;(2)取步骤(1)获得的基因组cDNA为模板,设计如下引物,对所述基因组DNA进行PCR扩增;(3)将步骤(2)获得的PCR扩增产物进行变性梯度凝胶电泳处理,分析所得的凝胶图谱,然后回收凝胶条带,以所述条带的回收产物为模板,设计以下引物,进行PCR扩增;(4)将步骤(3)获得的PCR扩增产物切胶回收、纯化,将PCR产物进行克隆测序,然后登陆Genbank进行测序比对,得到所述诺如病毒的基因类型。所述的方法测定结果准确、稳定可靠,灵敏度高以及检测费用低。 | ||
搜索关键词: | 一种 病毒 溯源 方法 及其 引物 试剂盒 应用 | ||
【主权项】:
一种基于PCR‑DGGE的诺如病毒溯源方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)富集诺如病毒并提取所述诺如病毒的基因组RNA,以获得所述基因组RNA为mRNA进行反转录得到cDNA,备用;(2)取步骤(1)获得的基因组cDNA为模板,以如下引物,对所述基因组DNA进行PCR扩增;上游引物F:5‘‑ATGTTCMGMTGGATGMGATTC‑3’;下游引物GC‑R:5‘‑CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGGCGGGGCGGGGGCGCGGGGGGTMGACGCCATCWTCATTYAC‑3’;(3)将步骤(2)获得的PCR扩增产物进行变性梯度凝胶电泳处理,分析所得的凝胶图谱,然后回收凝胶条带,以所述条带的回收产物为模板,以如下引物,进行PCR扩增;上游引物F:5‘‑ATGTTCMGMTGGATGMGATTC‑3’;下游引物R:5‘‑TMGACGCCATCWTCATTYAC‑3’;(4)将步骤(3)获得的PCR扩增产物进行电泳,然后切胶回收、纯化,将所得PCR扩增产物进行克隆测序,然后登陆Genbank进行测序比对,得到所述诺如病毒的基因类型。
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