[发明专利]用于预测肠杆菌属物种对抗微生物剂的抗性的基因测试

摘要

本申请涉及确定患者感染对抗微生物药物治疗可能具有抗性的肠杆菌属物种的方法，选择感染了具有抗生素抗性的肠杆菌属的患者的治疗的方法，和确定肠杆菌属物种细菌微生物的抗生素抗性谱的方法，以及用于这些方法的计算机程序产品。在示例性的方法中，样品(1)用于分子测试(2)，然后进行采集分子指纹(3)。随后将结果与参考文库(4)进行比较，并报告结果(5)。

主权项

1.确定患者感染对抗微生物药物如抗生素的治疗可能具有抗性的肠杆菌属(Enterobacter)物种的诊断方法，其包括下述步骤：a)获得或者提供来自所述患者的包含或疑似包含至少一种肠杆菌属物种的样品；b)确定来自下述基因的至少两种基因中至少一个突变的存在：ST548_p8085、ST548_p3778、ST548_p5387、ST548_p7737、ST548_p7940、ST548_p7919、ST548_p7543、ST548_p7426、ST548_p7336、ST548_p7239、ST548_p6918、ST548_p6844、ST548_p6794、ST548_p6618、ST548_p6494、ST548_p6478、ST548_p6451、ST548_p6386、ST548_p6367、ST548_p6066、ST548_p5966、ST548_p5904、ST548_p5779、ST548_p5658、ST548_p5474、ST548_p5447、ST548_p5300、ST548_p5259、ST548_p5115、ST548_p5081、ST548_p4891、ST548_p4836、ST548_p4577、ST548_p4310、ST548_p4203、ST548_p4107、ST548_p3593、ST548_p3452、ST548_p7944、ST548_p3464、ST548_p7296、ST548_p5257、ST548_p4364、ST548_p4137、ST548_p4611、ST548_p4841、ST548_p7855、ST548_p7086、ST548_p6814和ST548_p5341，和/或ENC_39630、ENC_32540、ENC_20090、ENC_34110、ENC_19160、ENC_00130、ENC_39120、ENC_23520、ENC_34890、ENC_01640、ENC_01700、ENC_12700、ENC_07150、ENC_18520、ENC_03650、ENC_03660、ENC_09780、ENC_18300、ENC_21490、ENC_42450、ENC_45970、ENC_06960、ENC_42440、ENC_44970、ENC_15210、ENC_16040、ENC_18950、ENC_34310、ENC_04740、ENC_26480、ENC_04560、ENC_21110、ENC_17620、ENC_15900、ENC_18290、ENC_26190、ENC_28140、ENC_42910、ENC_04700、ENC_29120、ENC_08830、ENC_33440、ENC_18400、ENC_32020、ENC_42660、ENC_13620、ENC_25610、ENC_02110、ENC_02570和ENC_06620；或者ST548_p8085、ST548_p3778、ST548_p5387、ST548_p7737、ST548_p5658和ST548_p4310，和/或ENC_39630、ENC_32540、ENC_20090、ENC_44710、ENC_46830、ENC_37880、ENC_04160、ENC_26410、ENC_05800、ENC_43540、ENC_38400和ENC_30490，其中存在所述至少两个突变表明所述患者感染了具有抗微生物药物抗性如抗生素抗性的肠杆菌属菌株。