[发明专利]用于预测寡养单胞菌属物种对抗微生物剂的抗性的基因测试在审

专利信息
申请号: 201680039469.3 申请日: 2016-07-25
公开(公告)号: CN108271396A 公开(公告)日: 2018-07-10
发明(设计)人: 安德烈亚斯·凯勒;苏珊娜·施默尔克;科德·弗里德里希·施塔勒;克里斯蒂娜·巴克斯;瓦伦蒂娜·加拉塔 申请(专利权)人: 阿瑞斯遗传股份有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689
代理公司: 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 代理人: 王达佐;洪欣
地址: 奥地利*** 国省代码: 奥地利;AT
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摘要: 本申请涉及确定患者感染对抗微生物药物治疗可能具有抗性的寡养单胞菌属物种的方法,选择对感染了具有抗生素抗性的寡养单胞菌属的患者的治疗的方法,和确定寡养单胞菌属物种细菌微生物的抗生素抗性谱的方法,以及用于这些方法的计算机程序产品。在示例性的方法中,样品1用于分子测试2,然后进行采集分子指纹3。随后将结果与参考文库4进行比较,并报告结果5。
搜索关键词: 寡养单胞菌属 抗生素抗性 物种 抗性 计算机程序产品 微生物药物 细菌微生物 报告结果 分子指纹 患者感染 基因测试 微生物剂 对抗 文库 治疗 采集 测试 参考 感染 预测 申请
【主权项】:
1.确定患者感染对抗微生物药物如抗生素治疗可能具有抗性的寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)物种的诊断方法,其包括下述步骤:a)获得或者提供来自所述患者的包含或疑似包含至少一种寡养单胞菌属物种的样品;b)确定来自下述基因的至少两种基因中至少一个突变的存在:SMD_3200、SMD_3579、SMD_3610、SMD_4135、SMD_3493、SMD_0995、SMD_2708、cbpD、SMD_2457、SMD_2911、gspL、SMD_2447、SMD_0184、SMD_1120、SMD_4120、SMD_0498、recF、fliK、rtcB、SMD_0069、SMD_1911、SMD_1996、glgX、SMD_4066、SMD_3568、ku、gcd、SMD_3572、SMD_3603、SMD_2199、SMD_2221、thiC、SMD_3992、SMD_3982、SMD_1353、StmPr1、SMD_3983、SMD_2572、tolA、SMD_1351、cyoA2、SMD_1123、SMD_1926、SMD_3570、SMD_2620、SMD_2277、SMD_1205、SMD_1639、SMD_2575和SMD_1320;或者SMD_3691、SMD_0155、glnD、SMD_0669、SMD_2553、SMD_3631、aspC、SMD_0301、SMD_2035、SMD_1117、SMD_1654、SMD_3927、nth、SMD_0861、SMD_1105、SMD_3707、fpr、petB、SMD_0692、SMD_3559、ftsW、yceG、SMD_1902、poxB、SMD_3500、SMD_1737、pepA、adi、hmgA、SMD_0173、SMD_4199、SMD_0947、ppk、SMD_3929、sspB、SMD_2800、SMD_3928、fadL、selD、otsA、SMD_2693、xpsD、atpG、SMD_1163、SMD_0676、SMD_1030、mgtE2、engB、uvrA和dsbA2,其中存在所述至少两个突变表明所述患者感染具有抗微生物药物抗性如抗生素抗性的寡养单胞菌属菌株。
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