[发明专利]一种InDel位点基因型分型的方法在审

专利信息
申请号: 201611160425.4 申请日: 2016-12-15
公开(公告)号: CN106399579A 公开(公告)日: 2017-02-15
发明(设计)人: 张德强;巩琛锐;杜庆章 申请(专利权)人: 北京林业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京高沃律师事务所11569 代理人: 王加贵
地址: 100089 北京市海淀*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种InDel位点基因型分型的方法,包括以下步骤1)将目的基因DNA序列进行T载体克隆测序,得到目的基因克隆产物序列,将所述目的基因克隆产物序列进行多重比对,得到InDel位点;2)根据所述InDel位点设计PCR扩增引物,所述PCR扩增引物包括正向引物和反向引物,所述正向引物的5'末端采用荧光基团修饰;3)用所述PCR扩增引物对待测样本DNA进行PCR扩增获得扩增产物,用毛细管荧光凝胶电泳检测扩增产物确定所述待测样本中InDel位点的基因型。本发明提供的基因型分型方法,成本低、操作简单灵活、结果准确。
搜索关键词: 一种 indel 基因型 方法
【主权项】:
一种InDel位点基因型分型的方法,包括以下步骤:1)将目的基因DNA序列进行T载体克隆测序,得到目的基因克隆产物序列,将所述目的基因克隆产物序列进行多重比对,得到InDel位点;2)根据所述InDel位点设计PCR扩增引物,所述PCR扩增引物包括正向引物和反向引物,所述正向引物的5'末端采用荧光基团修饰;3)用所述PCR扩增引物对待测样本全基因组DNA进行PCR扩增获得扩增产物,用毛细管荧光凝胶电泳检测扩增产物,若扩增产物中有两条条带则该InDel位点的基因型为杂合型ID;若有一条条带且片段大小与杂合型ID中大的片段相同,则该InDel位点基因型为插入纯合型II;若有一条条带且片段大小与杂合型ID中小的片段相同,则表示该InDel位点为缺失纯合型DD。
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