[发明专利]一种基于基因表达数据的混合网络基因筛选方法

摘要

本发明涉及基因诊断领域，尤其涉及一种基于基因表达数据的混合网络基因筛选方法；本方案通过引入基因表达数据，设计了基于基因表达数据的混合网络基因筛选方法模型，并给出了如何通过基因表达数据构建不同网络的具体步骤，利用基因表达数据对疾病与基因，基因与基因之间的相互关系网络进行了更为细致深入的量化，从而增强整个混合模型在疾病基因筛选方面的综合能力。

主权项

一种基于基因表达数据的混合网络基因筛选方法，其特征在于：包括以下步骤A.构建基因相互作用网络；所述基因相互作用网络包括待测基因转录后形成的蛋白质G以及与所述待测基因关系密切的N个基因转录后形成的蛋白质Gi，其中i＝1，2……n；B.构建疾病相似性网络；所述疾病相似性网络包括待测疾病D以及与所述D高度相似的疾病Di，其中i＝1，2……n，并使用矩阵Dsim[D_i,D_j]表示疾病i和疾病j之间的相似性；C.构建基因与疾病关联网络；所述基因与疾病关联网络包括已知的与所述疾病相似性网络中任意疾病存在相关性的所述基因相互作用网络中的蛋白质以及已知的与所述基因相互作用网络中任意蛋白质存在相关性的所述疾病相似性网络中的疾病，并用矩阵Adg[D,G]表示疾病D与基因G之间的关联性；D.所述基因与疾病关联网络中待测基因G的邻居与待测疾病D及其邻居的关联程度的总和，与所述待测基因G和所述待测疾病D之间的相关性成正比，使用方程1表达如下：其中Di为所述基因与疾病关联网络中待测疾病D之外的疾病；Gi为所述所述基因与疾病关联网络中待测基因转录后形成的蛋白质G之外的基因转录后形成的蛋白质。