[发明专利]蛋白质复合物的识别方法在审
申请号: | 201610356036.2 | 申请日: | 2016-05-26 |
公开(公告)号: | CN106021988A | 公开(公告)日: | 2016-10-12 |
发明(设计)人: | 赵军民;魏新红;张凯;张芳芳;杨斌;娄鑫坡;孔玉静 | 申请(专利权)人: | 河南城建学院 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京卓孚知识产权代理事务所(普通合伙) 11523 | 代理人: | 刘光明;张颖 |
地址: | 467036 河南省*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明公开一种蛋白质复合物的识别方法,包括如下步骤:构建带权的蛋白质相互作用网络,其中权值表示编码发生相互作用的蛋白质对应基因的表达模式之间的相似度;基于上述带权的蛋白质相互作用网络,识别蛋白质复合物的核;基于核内蛋白质与非核蛋白质发生相互作用的数量多少和权重大小来为蛋白质复合物的核识别附属蛋白质;以及将识别出的核与识别出的附属蛋白质进行组合,识别为蛋白质复合物。本方法不仅考虑了蛋白质复合物的内部结构,还要利用了编码相互作用蛋白质基因共表达程度高的特性。因此,该方法不仅可以识别具有重叠结构的蛋白质复合物,而且所识别的蛋白质复合物反映了蛋白质复合物的真实内部结构。 | ||
搜索关键词: | 蛋白质 复合物 识别 方法 | ||
【主权项】:
一种蛋白质复合物的识别方法,包括如下步骤:构建带权的蛋白质相互作用网络,其中权值表示编码发生相互作用的蛋白质对应基因的表达模式之间的相似度;基于上述带权的蛋白质相互作用网络,识别蛋白质复合物的核;基于核内蛋白质与非核蛋白质发生相互作用的数量多少和权重大小来为蛋白质复合物的核识别附属蛋白质;以及将识别出的核与识别出的附属蛋白质进行组合,识别为蛋白质复合物。
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