[发明专利]一种DNA及蛋白质水平突变分析系统有效
| 申请号： | 201610318327.2 | 申请日： | 2016-05-13 |
| 公开（公告）号： | CN106021980B | 公开（公告）日： | 2018-07-03 |
| 发明（设计）人： | 薛成海;龚永辉;刘宇 | 申请（专利权）人： | 万康源(天津)基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18 |
| 代理公司： | 天津滨海科纬知识产权代理有限公司 12211 | 代理人： | 李成运 |
| 地址： | 300220 天津市河西区*** | 国省代码： | 天津;12 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供了一种DNA及蛋白质水平突变分析系统，包括读取及索引判断模块，用于读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；判断突变发生的水平、突变的模式；判断突变命名是蛋白质水平突变或是基因组DNA水平突变或是CDS编码区突变；映射模块，用于根据读取及索引判断模块的判断结果，分别进入不同的水平突变映射流程，得到三种突变命名的映射关系。本发明承接文献挖掘的表型相关基因突变和多态位点，输出多种突变命名的映射关系，以达到完成注释文献挖掘的致病变异与测序识别的基因突变和多态位点间对应等目的。 | ||
| 搜索关键词： | 突变 读取 蛋白质水平 多态位点 基因突变 索引判断 突变分析 文献挖掘 映射关系 氨基酸密码子 表型相关基因 格式化处理 基因转录本 基因组DNA 基因信息 判断结果 映射模块 注释信息 编码区 关系表 转录本 映射 测序 构建 索引 承接 输出 | ||
【主权项】：
1.一种DNA及蛋白质水平突变分析系统，其特征在于，包括：读取及索引判断模块，用于读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；判断突变发生的水平、突变的模式；判断突变命名是蛋白质水平突变或是基因组DNA水平突变或是CDS编码区突变；映射模块，用于根据读取及索引判断模块的判断结果，分别进入不同的水平突变映射流程，得到三种突变命名的映射关系；所述映射模块连接所述读取及索引判断模块。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于万康源(天津)基因科技有限公司，未经万康源(天津)基因科技有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201610318327.2/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
